BOUCHAL, Pavel, Petra PŘECECHTĚLOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a Igor KUČERA. Protein composition of Paracoccus denitrificans cells grown on various electron acceptors and in the presence of azide. Proteomics. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, roč. 4, č. 9, s. 2662-2671. ISSN 1615-9853.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Protein composition of Paracoccus denitrificans cells grown on various electron acceptors and in the presence of azide
Název česky Proteinové složení buněk bakterie Paracoccus denitrificans rostlých na různých terminálních akceptorech a v přítomnosti azidu
Autoři BOUCHAL, Pavel (203 Česká republika, garant), Petra PŘECECHTĚLOVÁ (203 Česká republika), Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika) a Igor KUČERA (203 Česká republika).
Vydání Proteomics, Weinheim, Wiley-VCH, 2004, 1615-9853.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW Supplementary tables Publikace ve formátu pdf
Impakt faktor Impact factor: 5.483
Kód RIV RIV/00216224:14310/04:00010229
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000223801300017
Klíčová slova anglicky Paracoccus denitrificans; Protein database; Proteome; Terminal electron acceptor; Two-dimensional electrophoresis
Štítky Paracoccus denitrificans, Protein database, proteome, terminal electron acceptor, Two-dimensional electrophoresis
Změnil Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 12. 1. 2007 17:23.
Anotace
Two-dimensional gel electrophoresis with immobilised pH gradients was carried out on total cell lysates and membrane fractions of Paracoccus denitrificans with the aim to characterise differences in protein expression during growth under aerobic and various anaerobic conditions (with nitrate, nitrite or nitrous oxide). Comparative image analysis of the protein pattern revealed several subgroups of the total 800 protein spots resolved that were characteristically induced or repressed in response to individual electron acceptors. The respiratory inhibitor azide also exerted a profound influence upon cellular protein composition. However, since most of the proteins showing an altered expression pattern in cells growing on oxygen differed from those in cells growing on nitrite, we suppose that azide acts mainly indirectly, possibly by influencing other cellular signals. Limited information on the P. denitrificans genome has precluded the identification of more than 8 protein spots as yet. A public accessible P. denitrificans 2-DE protein database is currently built up at http://www.mpiib-berlin.mpg.de/2D-PAGE.
Anotace česky
Celobuněčné lyzáty a membránové frakce bakterie Paracoccus denitrificans byly analyzovány pomocí dvourozměrné elektroforézy s imobilizovanými pH gradienty s cílem charakterizovat rozdíly v expresi proteinů během růstu za aerobních a několika typech anaerobních podmínek (s dusičnanem, dusitanem a oxidem dusným). Komparativní obrazová analýza 2-D gelů odhalila několik skupin z celkového počtu 800 proteinových skvrn, které byly charakteristicky indukovány anebo potlačeny v odpovědi na daný terminální akceptor elektronů. Také respirační inhibitor azid vykazoval významné ovlivnění proteinových profilů. Jelikož však většina proteinů ovlivněných azidem v buňkách rostlých aerobně není totožná s proteiny v buňkách rostlých anaerobně na dusitanu, domníváme se, že azid účinkuje převážně nepřímo prostřednictvím dalších buněčných signálů. Omezená informace o genomu studované bakterie neumožnila identifikovat více než 8 fyziologicky významných proteinů. Veřejně dostupná 2-DE databáze P.denitrificans je dostupná na adrese http://www.mpiib-berlin.mpg.de/2D-PAGE.
Návaznosti
GA203/01/1589, projekt VaVNázev: Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí
Investor: Grantová agentura ČR, Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí
MSM 143100005, záměrNázev: Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
MSM 143100008, záměrNázev: Genomy a jejich funkce
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Genomy a jejich funkce
VytisknoutZobrazeno: 27. 4. 2024 03:39