2004
Protein composition of Paracoccus denitrificans cells grown on various electron acceptors and in the presence of azide
BOUCHAL, Pavel; Petra PŘECECHTĚLOVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL a Igor KUČERAZákladní údaje
Originální název
Protein composition of Paracoccus denitrificans cells grown on various electron acceptors and in the presence of azide
Název česky
Proteinové složení buněk bakterie Paracoccus denitrificans rostlých na různých terminálních akceptorech a v přítomnosti azidu
Autoři
Vydání
Proteomics, Weinheim, Wiley-VCH, 2004, 1615-9853
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Německo
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 5.483
Kód RIV
RIV/00216224:14310/04:00010229
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000223801300017
Klíčová slova anglicky
Paracoccus denitrificans; Protein database; Proteome; Terminal electron acceptor; Two-dimensional electrophoresis
Štítky
Změněno: 12. 1. 2007 17:23, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
V originále
Two-dimensional gel electrophoresis with immobilised pH gradients was carried out on total cell lysates and membrane fractions of Paracoccus denitrificans with the aim to characterise differences in protein expression during growth under aerobic and various anaerobic conditions (with nitrate, nitrite or nitrous oxide). Comparative image analysis of the protein pattern revealed several subgroups of the total 800 protein spots resolved that were characteristically induced or repressed in response to individual electron acceptors. The respiratory inhibitor azide also exerted a profound influence upon cellular protein composition. However, since most of the proteins showing an altered expression pattern in cells growing on oxygen differed from those in cells growing on nitrite, we suppose that azide acts mainly indirectly, possibly by influencing other cellular signals. Limited information on the P. denitrificans genome has precluded the identification of more than 8 protein spots as yet. A public accessible P. denitrificans 2-DE protein database is currently built up at http://www.mpiib-berlin.mpg.de/2D-PAGE.
Česky
Celobuněčné lyzáty a membránové frakce bakterie Paracoccus denitrificans byly analyzovány pomocí dvourozměrné elektroforézy s imobilizovanými pH gradienty s cílem charakterizovat rozdíly v expresi proteinů během růstu za aerobních a několika typech anaerobních podmínek (s dusičnanem, dusitanem a oxidem dusným). Komparativní obrazová analýza 2-D gelů odhalila několik skupin z celkového počtu 800 proteinových skvrn, které byly charakteristicky indukovány anebo potlačeny v odpovědi na daný terminální akceptor elektronů. Také respirační inhibitor azid vykazoval významné ovlivnění proteinových profilů. Jelikož však většina proteinů ovlivněných azidem v buňkách rostlých aerobně není totožná s proteiny v buňkách rostlých anaerobně na dusitanu, domníváme se, že azid účinkuje převážně nepřímo prostřednictvím dalších buněčných signálů. Omezená informace o genomu studované bakterie neumožnila identifikovat více než 8 fyziologicky významných proteinů. Veřejně dostupná 2-DE databáze P.denitrificans je dostupná na adrese http://www.mpiib-berlin.mpg.de/2D-PAGE.
Návaznosti
| GA203/01/1589, projekt VaV |
| ||
| MSM 143100005, záměr |
| ||
| MSM 143100008, záměr |
|