D 2004

Fast Marching 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes

MATULA, Pavel; Jan HUBENÝ a Michal KOZUBEK

Základní údaje

Originální název

Fast Marching 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes

Název česky

Rychle postupující 3D rekonstrukce chromozomů v interfázi

Autoři

Vydání

Berlin, Computer Vision and Mathematical Methods in Medical and Biomedical Image Analysis, od s. 385-394, 10 s. 2004

Nakladatel

Springer-Verlag

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Německo

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14330/04:00010340

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

3-540-22675-3

UT WoS

Klíčová slova anglicky

fast marching method; deformable models; 3D object reconstruction; biomedical application; interphase chromosome

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 7. 5. 2010 15:45, prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

Reliable 3D reconstruction of interphase chromosomes imaged using confocal microscopy is an important task in cell biology. Computer model of chromosome territories enables performing necessary measurements and consequently making morphological studies. A large number of processed objects is necessary to ensure statistical significance of the results. Therefore an automated procedure is needed. We have developed a successful algorithm for 3D reconstruction of chromosome territories on the basis of well-known fast marching algorithm. The fast marching algorithm solves front evolution problem similarly to deformable models but in an effective way with the time complexity O(n log n).

Česky

Spolehlivá 3D rekonstrukce chromozomů v interfázi s využitím konfokální mikroskopie je důležitý úkol buněčné biologie. Počítačový model chromozomové oblasti umožňuje provádět nezbytná měření a provádění morfologických studií. Pro zajištění statistické hodnověrnosti výsledků je nutné provádět měření na velkém množství objektů. Proto je požadován automatický postup. V článku je prezentován algoritmus založený na známé rychle pochodující (Fast Marching) metodě na 3D rekonstrukci chromozomálních oblestí. Fast marching algoritmus řeší problém pohybu rozhraní, podobně jako deformabilní modely, ale v efektivním čase O(n log n).

Návaznosti

GP204/03/D034, projekt VaV
Název: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
Investor: Grantová agentura ČR, Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
MSM 143300002, záměr
Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii