MATULA, Pavel, Jan HUBENÝ a Michal KOZUBEK. Fast Marching 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes. In Computer Vision and Mathematical Methods in Medical and Biomedical Image Analysis. Berlin: Springer-Verlag, 2004, s. 385-394. ISBN 3-540-22675-3.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Fast Marching 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes
Název česky Rychle postupující 3D rekonstrukce chromozomů v interfázi
Autoři MATULA, Pavel (203 Česká republika, garant), Jan HUBENÝ (203 Česká republika) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika).
Vydání Berlin, Computer Vision and Mathematical Methods in Medical and Biomedical Image Analysis, od s. 385-394, 10 s. 2004.
Nakladatel Springer-Verlag
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14330/04:00010340
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 3-540-22675-3
UT WoS 000224372600033
Klíčová slova anglicky fast marching method; deformable models; 3D object reconstruction; biomedical application; interphase chromosome
Štítky 3D object reconstruction, biomedical application, deformable models, fast marching method, interphase chromosome
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., učo 3740. Změněno: 7. 5. 2010 15:45.
Anotace
Reliable 3D reconstruction of interphase chromosomes imaged using confocal microscopy is an important task in cell biology. Computer model of chromosome territories enables performing necessary measurements and consequently making morphological studies. A large number of processed objects is necessary to ensure statistical significance of the results. Therefore an automated procedure is needed. We have developed a successful algorithm for 3D reconstruction of chromosome territories on the basis of well-known fast marching algorithm. The fast marching algorithm solves front evolution problem similarly to deformable models but in an effective way with the time complexity O(n log n).
Anotace česky
Spolehlivá 3D rekonstrukce chromozomů v interfázi s využitím konfokální mikroskopie je důležitý úkol buněčné biologie. Počítačový model chromozomové oblasti umožňuje provádět nezbytná měření a provádění morfologických studií. Pro zajištění statistické hodnověrnosti výsledků je nutné provádět měření na velkém množství objektů. Proto je požadován automatický postup. V článku je prezentován algoritmus založený na známé rychle pochodující (Fast Marching) metodě na 3D rekonstrukci chromozomálních oblestí. Fast marching algoritmus řeší problém pohybu rozhraní, podobně jako deformabilní modely, ale v efektivním čase O(n log n).
Návaznosti
GP204/03/D034, projekt VaVNázev: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
Investor: Grantová agentura ČR, Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
MSM 143300002, záměrNázev: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
VytisknoutZobrazeno: 19. 9. 2024 22:15