High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis

MATULA, Pavel, Petr MATULA, Michal KOZUBEK a Petr MEJZLÍK. High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis. In 2nd International Symposium on 3D Data Processing, Visualization, and Transmission. Los Alamitos: IEEE Computer Society, 2004, s. 580-583. ISBN 0-7695-2223-8.

Základní údaje

• Originální název: High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis
• Název česky: Projekt Síťové cytometrie s vysokým rozlišením: Klient/server system pro 3D optickou mikroskopii
• Autoři: MATULA, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), Petr MATULA (203 Česká republika, domácí), Michal KOZUBEK (203 Česká republika, domácí) a Petr MEJZLÍK (203 Česká republika).
• Vydání: Los Alamitos, 2nd International Symposium on 3D Data Processing, Visualization, and Transmission, od s. 580-583, 4 s. 2004.
• Nakladatel: IEEE Computer Society

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
• Stát vydavatele: Spojené státy
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Forma vydání: tištěná verze "print"
• Kód RIV: RIV/00216224:14330/04:00010341
• Organizační jednotka: Fakulta informatiky
• ISBN: 0-7695-2223-8
• UT WoS: 000224459000076
• Klíčová slova anglicky: 3d image processing; high-resolution cytometry
• Štítky: 3d image processing, high-resolution cytometry
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

If several laboratories work in the same field and need to cooperate, it is necessary to exchange and mutually compare their computer results. The quick way to solve this problem is to unite their file formats (if it is practicable) or to install new software systems, which are data or file format compatible. A much better solution is to use only one common system. This article describes the architecture of a new client-server system, which offers possibilities of effective cooperation for laboratories doing the research in the field of the spatial organization of human genome. However, the system design is determined mainly by optical microscopy principles and therefore the system can easily be modified for use in other applications or environments. The most pressing problem during the system design was how to share and process large 3D image data in client-server architecture.

Anotace česky

Pokud pracuje několik laboratoří ve stejném oboru a potřebují spolupracovat, tak si musí nezbytně vyměňovat a vzájemně srovnávat své počítačové výsledky. Rychlý způsob jak vyřešit tento problém je sjednotit souborové formáty nebo nainstalovat takové softwarové systémy, které jsou datově kompatibilní. Lepším řešením je samozřejmě používat pouze jeden společný systém. Článek popisuje architekturu nového klient-server systému, který nabízí možnost efektivní spolupráce laboratoří pracujících na výzkumu v oblasti studia prostorového uspořádání lidského genomu. Návrh systému je však určen především principy optické mikroskopie a je ho proto možné snadno upravit i pro jiné aplikace a prostředí. Nejpalčivějším problémem při návrhu systému bylo jak sdílet a zpracovávat objemná 3D obrazová data v klient-server architektuře.

Návaznosti

• GP204/03/D034, projekt VaV: Název: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie

Investor: Grantová agentura ČR, Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie

• MSM 143300002, záměr: Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii