Klasifikace komplexu Staphylococcus sciuri z humánního
klinického materiálu

J 2004

Klasifikace komplexu Staphylococcus sciuri z humánního klinického materiálu

SEDLÁČEK, Ivo; Vlastimil ŠTĚTINA; Roman PANTŮČEK a Petr PETRÁŠ

Základní údaje

Originální název

Klasifikace komplexu Staphylococcus sciuri z humánního klinického materiálu

Název anglicky

Classification of Staphylococcus sciuri complex from human clinical specimens

Autoři

SEDLÁČEK, Ivo; Vlastimil ŠTĚTINA; Roman PANTŮČEK a Petr PETRÁŠ

Vydání

Správy klinickej mikrobiológie, Bratislava, Sekcia klinickej mikrobiológie, Mikrobiologicko-epidemiologickej spoločnosti, Slovenskej lekárskej spoločnosti, 2004, 1335-8219

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Slovensko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/04:00011592

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

Staphylococcus sciuri; molecular epidemiology; methicillin resistance

Štítky

methicillin resistance, molecular epidemiology, Staphylococcus sciuri

Změněno: 31. 3. 2010 11:25, prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc.

Anotace

ORIG EN

V originále

Koaguláza negativní stafylokoky jsou běžnou součástí mikroflóry kůže i kožních žláz teplokrevných živočichů včetně člověka, ale mohou se též podílet na vzniku různých infekčních onemocnění, a to především u oslabených jedinců. Z humánního klinického materiálu jsou občas izolováni zástupci komplexu Staphylococcus sciuri, původně spojovaní pouze s výskytem u živočichů, případně v potravinách. Druh S. sciuri má význam i hlediska přítomnosti homologu genu mecA, považovaného za předchůdce genu pro rezistenci k meticilinu neseného kmeny MRSA. V naší studii jsme pomocí ribotypizace, PCR a biotypizace analyzovali 72 humánních izolátů komplexu S. sciuri spolu s 6 referenčními typovými kulturami. Ribotypizace byla prováděna restrikčním enzymem EcoRI a sondou komplementární s 16S a 23S rRNA, vyhodnocení ribotypů bylo pomocí programu GelCompar II. K biotypizaci byly použity soupravy API Staph a ID 32 Staph včetně některých klíčových konvečních testů a dále analýza profilu celobuněčných proteinů (1D SDS-PAGE). Biochemická identifikace izolátů komplexu S. sciuri založená na výsledcích komerčních souprav byla často nejednoznačná a vyžadovala provedení dodatečných testů. U všech izolátů a referenčních kmenů byla metodou PCR prokázána přítomnost genu mecA. Dva izolázy (P602 a P607) nesly dvě různé kopie genu mecA. U 55 izolátů byl gen mecA podrobně typizován metodou PCR-RFLP s restrikčním enzymem MseI. Tato analýza odhalila přítomnost 5 různých RFLP profilů, které nekorelovaly s taxonomickým zařazením kmenů. Všechny izoláty i referenční kmeny byly jednoznačně navzájem odlišitelné svými ribotypy, a to až na úroveň podruhu. Fenotypově velmi podobné druhy S. sciuri a S. lentus byly odlišeny jak ribotypizací, tak i analýzou SDS-PAGE a obě tyto metodiky umožňují spolehlivou identifikaci S. lentus. Izoláty druhu S. sciuri se na základě svých EcoRI hybridizačních profilů vyčlenily do šesti skupin taxonomicky reprezentujících jednotlivé poddruhy, zatímco výsledky SDS-PAGE u téhož souboru jsou obecně použitelné pouze pro typizaci kmenů navzájem mezi sebou. Toto studium kmenů humánního původu ukázalo nižší použitelnost komerčních identifikačních souprav či SDS-PAGE metody pro vnitrodruhovou identifikaci komplexu S. sciuri. Výsledky ribotypizace jednoznačně prokázaly výskyt taxonů S. lentus, S. sciuri subsp. sciuri, S. sciuri subsp. carnaticus a S. sciuri subsp. rodentium v humánním klinickém materiálu. Ribotypizace je tak vhodným nástrojem pro odlišení taxonů komplexu S. sciuri.

Anglicky

We have analysed 72 Staphylococcus sciuri strains from human clinical material by ribotyping, PCR, SDS-PAGE and biotyping.

Návaznosti

GA301/02/1505, projekt VaV

Název: Molekulární diagnostika, epidemiologie a klasifikace klinicky významných grampozitivních koků

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární diagnostika, epidemiologie a klasifikace klinicky významných grampozitivních koků

Citovat

SEDLÁČEK, Ivo; Vlastimil ŠTĚTINA; Roman PANTŮČEK a Petr PETRÁŠ. Klasifikace komplexu Staphylococcus sciuri z humánního klinického materiálu. Správy klinickej mikrobiológie. Bratislava: Sekcia klinickej mikrobiológie, Mikrobiologicko-epidemiologickej spoločnosti, Slovenskej lekárskej spoločnosti, 2004, roč. 4, Suppl. B., s. 59-60. ISSN 1335-8219.

@article{558809,
   author = {Sedláček, Ivo and Štětina, Vlastimil and Pantůček, Roman and Petráš, Petr},
   article_location = {Bratislava},
   article_number = {Suppl. B.},
   keywords = {Staphylococcus sciuri; molecular epidemiology; methicillin resistance},
   language = {cze},
   issn = {1335-8219},
   journal = {Správy klinickej mikrobiológie},
   note = {XII. Moravsko Slovenské mikrobiologické dni, Tatranská Lomnica, 27.-29.9.2004},
   title = {Klasifikace komplexu Staphylococcus sciuri z humánního klinického materiálu},
   volume = {4},
   year = {2004}
}

TY  - JOUR
ID  - 558809
AU  - Sedláček, Ivo - Štětina, Vlastimil - Pantůček, Roman - Petráš, Petr
PY  - 2004
TI  - Klasifikace komplexu Staphylococcus sciuri z humánního klinického materiálu
JF  - Správy klinickej mikrobiológie
VL  - 4
IS  - Suppl. B.
SP  - 59-60
EP  - 59-60
PB  - Sekcia klinickej mikrobiológie, Mikrobiologicko-epidemiologickej spoločnosti, Slovenskej lekárskej spoločnosti
SN  - 13358219
N1  - XII. Moravsko Slovenské mikrobiologické dni, Tatranská Lomnica, 27.-29.9.2004
KW  - Staphylococcus sciuri
KW  - molecular epidemiology
KW  - methicillin resistance
N2  - Koaguláza negativní stafylokoky jsou běžnou součástí mikroflóry kůže i kožních žláz teplokrevných živočichů včetně člověka, ale mohou se též podílet na vzniku různých infekčních onemocnění, a to především u oslabených jedinců. Z humánního klinického materiálu jsou občas izolováni zástupci komplexu Staphylococcus sciuri, původně spojovaní pouze s výskytem u živočichů, případně v potravinách. Druh S. sciuri má význam i hlediska přítomnosti homologu genu mecA, považovaného za předchůdce genu pro rezistenci k meticilinu neseného kmeny MRSA. V naší studii jsme pomocí ribotypizace, PCR a biotypizace analyzovali 72 humánních izolátů komplexu S. sciuri spolu s 6 referenčními typovými kulturami. Ribotypizace byla prováděna restrikčním enzymem EcoRI a sondou komplementární s 16S a 23S rRNA, vyhodnocení ribotypů bylo pomocí programu GelCompar II. K biotypizaci byly použity soupravy API Staph a ID 32 Staph včetně některých klíčových konvečních testů a dále analýza profilu celobuněčných proteinů (1D SDS-PAGE). Biochemická identifikace izolátů komplexu S. sciuri založená na výsledcích komerčních souprav byla často nejednoznačná a vyžadovala provedení dodatečných testů. U všech izolátů a referenčních kmenů byla metodou PCR prokázána přítomnost genu mecA. Dva izolázy (P602 a P607) nesly dvě různé kopie genu mecA. U 55 izolátů byl gen mecA podrobně typizován metodou PCR-RFLP s restrikčním enzymem MseI. Tato analýza odhalila přítomnost 5 různých RFLP profilů, které nekorelovaly s taxonomickým zařazením kmenů. Všechny izoláty i referenční kmeny byly jednoznačně navzájem odlišitelné svými ribotypy, a to až na úroveň podruhu. Fenotypově velmi podobné druhy S. sciuri a S. lentus byly odlišeny jak ribotypizací, tak i analýzou SDS-PAGE a obě tyto metodiky umožňují spolehlivou identifikaci S. lentus. Izoláty druhu S. sciuri se na základě svých EcoRI hybridizačních profilů vyčlenily do šesti skupin taxonomicky reprezentujících jednotlivé poddruhy, zatímco výsledky SDS-PAGE u téhož souboru jsou obecně použitelné pouze pro typizaci kmenů navzájem mezi sebou. Toto studium kmenů humánního původu ukázalo nižší použitelnost komerčních identifikačních souprav či SDS-PAGE metody pro vnitrodruhovou identifikaci komplexu S. sciuri. Výsledky ribotypizace jednoznačně prokázaly výskyt taxonů S. lentus, S. sciuri subsp. sciuri, S. sciuri subsp. carnaticus a S. sciuri subsp. rodentium v humánním klinickém materiálu. Ribotypizace je tak vhodným nástrojem pro odlišení taxonů komplexu S. sciuri.
ER  -

SEDLÁČEK, Ivo; Vlastimil ŠTĚTINA; Roman PANTŮČEK a Petr PETRÁŠ. Klasifikace komplexu $<$I$>$Staphylococcus sciuri$<$/I$>$ z humánního klinického materiálu. \textit{Správy klinickej mikrobiológie}. Bratislava: Sekcia klinickej mikrobiológie, Mikrobiologicko-epidemiologickej spoločnosti, Slovenskej lekárskej spoločnosti, 2004, roč.~4, Suppl. B., s.~59-60. ISSN~1335-8219.

Přehled o publikaci