J 2005

The trnL-F plastid DNA characters of three Poa pratensis (Kentucky bluegrass) varieties

STONEBERG HOLT, Sierra Dawn; Lucie HOROVÁ; Petr BUREŠ; Josef JANEČEK; Vladimír ČERNOCH et al.

Základní údaje

Originální název

The trnL-F plastid DNA characters of three Poa pratensis (Kentucky bluegrass) varieties

Název česky

Charakterizace tří odrůd lipnice luční na základě sekvence plastidové DNA v úseku trnL-F

Autoři

STONEBERG HOLT, Sierra Dawn; Lucie HOROVÁ; Petr BUREŠ; Josef JANEČEK a Vladimír ČERNOCH

Vydání

Plant, Soil and Environment, Praha, Czech Academy of Agricultural Sciences, 2005, 1214-1178

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

40100 4.1 Agriculture, Forestry, and Fisheries

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 0.170 v roce 2004

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/05:00013561

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

cultivar characterization; Harmonie; Moravanka; non-coding plastid DNA sequence; Slezanka; trnL intron; trnL-trnF intergenic spacer; turf grass
Změněno: 26. 1. 2007 10:51, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D.

Anotace

V originále

The characterization of crop cultivars (varieties) will come to depend increasingly on molecular characters in addition to traditional morphological and agronomic characters. Three cultivars of Kentucky bluegrass (Poa pratensis L.), developed by the Plant Breeding Station Hladké Životice (PBHŽ), were characterized using sequences and PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism) patterns from the non-coding plastid trnL-F region (trnL intron, 549 bp, and trnL-trnF intergenic spacer [IGS], 344 to 364 bp). These characters could be readily and repeatably determined not only for mature plants, but also for seedlings (less than 12 weeks old), which are difficult to distinguish morphologically. The method is quick and sensitive. When restricted with a combination of BsaJ I and Bsm I, cultivar Slezanka has one major band, Moravanka has two, and Harmonie has three. When restricted with Alu I, the heaviest band migrates most slowly for Slezanka. It is expected that many Kentucky bluegrass cultivars will share the same trnL-F sequence, so these characters alone are not sufficient for variety identification.

Česky

Charakterizace odrůd se bude stále více opírat o molekulární markery, které doplní tradiční a doposud užívané morfologické a agronomické znaky. Tři odrůdy lipnice luční, vyšlechtěné ve šlechtitelské stanici Hladké Životice (PBHŽ), byly charakterizovány pomocí sekvence DNA a PCR-RFLP (polymorfní restrikční fragmenty z produktů PCR reakce) profilů pro nekódující plastidový DNA úsek trnL-F (trnL intron, 549 pb, a trnL-trnF intergenový spacer [IGS], 344 až 364 pb). Tyto znaky byly zjištěny opakovaně a spolehlivě nejen u dospělých rostlin ale i u semenáčků (mladší než 12 týdnů), které jsou morfologicky těžce rozlišitelné. Metoda je rychlá a citlivá. Kombinace restrikční endonukleázy BsaJ I a Bsm I štěpí 'Slezanku' na jeden hlavní proužek (fragment), 'Moravanku' na dva a 'Harmonii' na tři. Restrikční endonukleáza Alu I vyštěpí největší fragment u odrůdy 'Slezanka'. Je však pravděpodobné, že většina odrůd lipnice luční bude mít sekvenci úseků trnL-F stejnou, takže tento znak samostatně je pro jistou identifikaci všech odrůd nedostatečný.

Návaznosti

MSM 143100010, záměr
Název: Časoprostorová dynamika biodiverzity v ekosystémech střední Evropy.
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Časoprostorová dynamika biodiverzity v ekosystémech střední Evropy
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase