Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits

MATULA, Pavel, Michal KOZUBEK, Stanislav KOZUBEK a Vladan ONDŘEJ. Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits. In Biophysics of the Genome. Brno, Czech Republic: Masaryk University, 2004, s. 58-61. ISBN 80-210-3560-9.

Základní údaje

• Originální název: Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits
• Název česky: Rychlé snímání obrazu živých buněk a jeho limity
• Autoři: MATULA, Pavel (203 Česká republika, garant), Michal KOZUBEK (203 Česká republika), Stanislav KOZUBEK (203 Česká republika) a Vladan ONDŘEJ (203 Česká republika).
• Vydání: Brno, Czech Republic, Biophysics of the Genome, od s. 58-61, 4 s. 2004.
• Nakladatel: Masaryk University

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: 20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14330/04:00009696
• Organizační jednotka: Fakulta informatiky
• ISBN: 80-210-3560-9
• Klíčová slova anglicky: Image analysis
• Štítky: Image analysis
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

Technique of high-resolution cytometry (HRCM) developed in our laboratory is capable of automated (2D as well as 3D) acquisition and analysis of fluorescent stained cells. The cytometer can process large number of cells with high resolution. The acquisition can be repeated in time and that enables live cell studies. If very short events in living cells are studied then the sampling frequency must be high. The highest sampling frequency depends on the technical parameters of the motorized parts of cytometer (especially on the camera frame rate, the speed of filter exchange and the speed of axial movement) and on the control software, which must be appropriately optimized. The limits of the current setup are discussed and available sampling frequencies for different acquisition modes are listed.

Anotace česky

Technika cytometrie s vysokým rozlišením (HRCM), která byla vyvinuta v naší laboratoři, umožňuje automaticky snímat (2D i 3D) a analyzovat fluorescenčně obarvené buňky. Cytometr je schopen zpracovat velké množství buněk s vysokým rozlišením. Snímání je možné opakovat v čase a to umožňuje provádět studie na živých buňkách. Pokud jsou studovány velmi krátké děje v buňkách tak je nutné zajistit velkou vzorkovací frekvenci. Nejlepší vzorkovací frekvence, které lze dosáhnout, závisí na technických parametrech automatizovaných částí cytometru (zejména snímací rychlosti kamery, rychlosti výměny filtrů a rychlosti axiálního pohybu) a na řídícím software, který musí být náležitě optimaliziván. V článku jsou diskutovány limity současné sestavy a pro různé snímací módy je uveden přehled dostupných vzorkovacích frekvencí.

Návaznosti

• GA202/04/0907, projekt VaV: Název: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách

Investor: Grantová agentura ČR, Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách

• GP204/03/D034, projekt VaV: Název: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie

Investor: Grantová agentura ČR, Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie

• IAA5004306, projekt VaV: Název: Struktura lidského genomu

Investor: Akademie věd ČR, Struktura lidského genomu

• IBS5004010, projekt VaV: Název: Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii

Investor: Akademie věd ČR, Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii

• MSM 143300002, záměr: Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii