Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits

MATULA, Pavel, Michal KOZUBEK, Stanislav KOZUBEK and Vladan ONDŘEJ. Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits. In Biophysics of the Genome. Brno, Czech Republic: Masaryk University, 2004, p. 58-61. ISBN 80-210-3560-9.

Basic information

• Original name: Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits
• Name in Czech: Rychlé snímání obrazu živých buněk a jeho limity
• Authors: MATULA, Pavel (203 Czech Republic, guarantor), Michal KOZUBEK (203 Czech Republic), Stanislav KOZUBEK (203 Czech Republic) and Vladan ONDŘEJ (203 Czech Republic).
• Edition: Brno, Czech Republic, Biophysics of the Genome, p. 58-61, 4 pp. 2004.
• Publisher: Masaryk University

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: 20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14330/04:00009696
• Organization unit: Faculty of Informatics
• ISBN: 80-210-3560-9
• Keywords in English: Image analysis
• Tags: Image analysis
• Tags: International impact

Abstract

Technique of high-resolution cytometry (HRCM) developed in our laboratory is capable of automated (2D as well as 3D) acquisition and analysis of fluorescent stained cells. The cytometer can process large number of cells with high resolution. The acquisition can be repeated in time and that enables live cell studies. If very short events in living cells are studied then the sampling frequency must be high. The highest sampling frequency depends on the technical parameters of the motorized parts of cytometer (especially on the camera frame rate, the speed of filter exchange and the speed of axial movement) and on the control software, which must be appropriately optimized. The limits of the current setup are discussed and available sampling frequencies for different acquisition modes are listed.

Abstract (in Czech)

Technika cytometrie s vysokým rozlišením (HRCM), která byla vyvinuta v naší laboratoři, umožňuje automaticky snímat (2D i 3D) a analyzovat fluorescenčně obarvené buňky. Cytometr je schopen zpracovat velké množství buněk s vysokým rozlišením. Snímání je možné opakovat v čase a to umožňuje provádět studie na živých buňkách. Pokud jsou studovány velmi krátké děje v buňkách tak je nutné zajistit velkou vzorkovací frekvenci. Nejlepší vzorkovací frekvence, které lze dosáhnout, závisí na technických parametrech automatizovaných částí cytometru (zejména snímací rychlosti kamery, rychlosti výměny filtrů a rychlosti axiálního pohybu) a na řídícím software, který musí být náležitě optimaliziván. V článku jsou diskutovány limity současné sestavy a pro různé snímací módy je uveden přehled dostupných vzorkovacích frekvencí.

Links

• GA202/04/0907, research and development project: Name: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách

Investor: Czech Science Foundation, High-resolution cytometry of living cells

• GP204/03/D034, research and development project: Name: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie

Investor: Czech Science Foundation, Threedimensional analysis of cell nuclei using image cytometry

• IAA5004306, research and development project: Name: Struktura lidského genomu

Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Human genome structure

• IBS5004010, research and development project: Name: Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii

Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Development of new diagnostic teniques for oncology

• MSM 143300002, plan (intention): Name: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Application of computer image analysis in optical microscopy