D 2004

Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits

MATULA, Pavel, Michal KOZUBEK, Stanislav KOZUBEK a Vladan ONDŘEJ

Základní údaje

Originální název

Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits

Název česky

Rychlé snímání obrazu živých buněk a jeho limity

Autoři

MATULA, Pavel (203 Česká republika, garant), Michal KOZUBEK (203 Česká republika), Stanislav KOZUBEK (203 Česká republika) a Vladan ONDŘEJ (203 Česká republika)

Vydání

Brno, Czech Republic, Biophysics of the Genome, od s. 58-61, 4 s. 2004

Nakladatel

Masaryk University

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14330/04:00009696

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

80-210-3560-9

Klíčová slova anglicky

Image analysis

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 3. 6. 2010 15:53, doc. RNDr. Pavel Matula, Ph.D.

Anotace

V originále

Technique of high-resolution cytometry (HRCM) developed in our laboratory is capable of automated (2D as well as 3D) acquisition and analysis of fluorescent stained cells. The cytometer can process large number of cells with high resolution. The acquisition can be repeated in time and that enables live cell studies. If very short events in living cells are studied then the sampling frequency must be high. The highest sampling frequency depends on the technical parameters of the motorized parts of cytometer (especially on the camera frame rate, the speed of filter exchange and the speed of axial movement) and on the control software, which must be appropriately optimized. The limits of the current setup are discussed and available sampling frequencies for different acquisition modes are listed.

Česky

Technika cytometrie s vysokým rozlišením (HRCM), která byla vyvinuta v naší laboratoři, umožňuje automaticky snímat (2D i 3D) a analyzovat fluorescenčně obarvené buňky. Cytometr je schopen zpracovat velké množství buněk s vysokým rozlišením. Snímání je možné opakovat v čase a to umožňuje provádět studie na živých buňkách. Pokud jsou studovány velmi krátké děje v buňkách tak je nutné zajistit velkou vzorkovací frekvenci. Nejlepší vzorkovací frekvence, které lze dosáhnout, závisí na technických parametrech automatizovaných částí cytometru (zejména snímací rychlosti kamery, rychlosti výměny filtrů a rychlosti axiálního pohybu) a na řídícím software, který musí být náležitě optimaliziván. V článku jsou diskutovány limity současné sestavy a pro různé snímací módy je uveden přehled dostupných vzorkovacích frekvencí.

Návaznosti

GA202/04/0907, projekt VaV
Název: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách
Investor: Grantová agentura ČR, Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách
GP204/03/D034, projekt VaV
Název: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
Investor: Grantová agentura ČR, Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
IAA5004306, projekt VaV
Název: Struktura lidského genomu
Investor: Akademie věd ČR, Struktura lidského genomu
IBS5004010, projekt VaV
Název: Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
Investor: Akademie věd ČR, Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
MSM 143300002, záměr
Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii