D 2004

Clustering of genes with similar regulation patterns during monocyte and granulocyte differentiation of HL-60 cells

KOUTNÁ, Irena; Eva JANSOVÁ; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Tomáš PAVLÍK et al.

Základní údaje

Originální název

Clustering of genes with similar regulation patterns during monocyte and granulocyte differentiation of HL-60 cells

Název česky

Shlukování genů s podobnými regulačními vzory během monocytické a granulocytické diferenciace buněk HL-60

Autoři

Vydání

First Edition 2004. Brno, Biophysics of the Genome, od s. 38-43, 6 s. 2004

Nakladatel

Masaryk University

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14330/04:00010790

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

80-210-3560-9

Klíčová slova anglicky

microarrayc

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 29. 10. 2010 14:35, prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

In the present study, a high density-microarrays of human cDNA containing 19,000 genetic elements were used to search for differences in gene expression of human promyelic leukaemia cell line HL-60 during monocyte (MD) and granulocyte differentiation (GD). For differentiation to monocytes (granulocytes), the TPA, 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate (DMSO) were used, respectively. A total number of 4625 (4760) genes were found to be regulated during MD (GD). The genes have been divided into groups according to their kinetics of regulation (R-groups). The genes of the same group are not distributed randomly throughout the genome but form clusters on chromosomes (R-clusters). Thus, functionally interconnected genes are frequently localized near to each other on the DNA molecule. In addition, genes of R-groups of MD (GD), if projected to GD (MD) happen to be mostly found in one or several R-groups of the other type, although the kinetics of regulation may be different (e.g. group 9 of GD and group 12 of MD). However, in most cases similar patterns of regulation correspond to each other (15, 16 of GD correspond to 3, 4 of MD).

Česky

Shlukování genů s podobnými regulačními vzory během monocytické a granulocytické diferenciace buněk HL-60.

Návaznosti

GP301/04/P136, projekt VaV
Název: Včasná diagnostika leukémií užitím technologie DNA-mikročipů a sledováním epigenetických změn
Investor: Grantová agentura ČR, Včasná diagnostika leukémií užitím technologie DNA-mikročipů a sledováním epigenetických změn
MSM 143300002, záměr
Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
1A8241, projekt VaV
Název: Nové možnosti diagnostiky leukémií s využitím technologie DNA-mikročipů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Nové možnosti diagnostiky leukémie s využitím technologie DNA-mikročipů