Cytological study of DNA methylation and histone methylation patterns in human cell lines

SKALNÍKOVÁ, Magdalena; Eva BÁRTOVÁ; Stanislav KOZUBEK a Michal KOZUBEK. Cytological study of DNA methylation and histone methylation patterns in human cell lines. In Biophysics of the Genome. First Edition 2004. Brno: Masaryk University, 2004, s. 72-75. ISBN 80-210-3560-9.

Základní údaje

Originální název

Cytological study of DNA methylation and histone methylation patterns in human cell lines

Název česky

Cytologická studie chování DNA metylace a histonové metylace v lidských buněčných liniích

Autoři

SKALNÍKOVÁ, Magdalena; Eva BÁRTOVÁ; Stanislav KOZUBEK a Michal KOZUBEK

Vydání

First Edition 2004. Brno, Biophysics of the Genome, od s. 72-75, 4 s. 2004

Nakladatel

Masaryk University

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14330/04:00009706

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

80-210-3560-9

Klíčová slova anglicky

cytometry

Štítky

Cytometry

Příznaky

Mezinárodní význam

---

Anotace

V originále

Epigenetic processes are defined as heritable changes in genome function that occur without a change in DNA sequence. Gene expression, chromosome segregation, DNA replication, repair, and recombination all act, not on DNA alone, but on the chromatin template. DNA methylation, along with histone lysine methylation, establishes the framework for long-term epigenetic maintenance. The discovery that enzymes can (re)organise chromatin into accessible and inaccessible configurations revealed epigenetic mechanisms that considerably extend the information potential of the genetic code. In mammals, heterochromatin is characterised by DNA methylation at CpG dinucleotides and methylation at lysine 9 of histone 3 (H3- K9), whereas euchromatin is associated with methylation at lysine 4 of histone 3 (H3-K4). In our experiments, the detection of DNA methylated regions at chromosomal level was performed using indirect immunofluorescence technique combined with FISH. The selected metaphase chromosomes HSA 2 were determined using FISH. Sequential 5-methylcytosin rich regions were visualised using immunofluorescent labelling in retinoblastoma cell line Y79 and in leukemic cell line K562. Our model study is partly focused on the global histone H3-K4 and H3-K9 trimethylation studied by qualitative immunohistochemistry in retinoblastoma cells Y79 and leukemic cells K562. Our results highlight the importance of the relationships between histone modifications and DNA methylation, however the mutual connection between individual epigenetic hereditary mechanisms has not been made clear yet.

Česky

Cytologická studie chování DNA metylace a histonové metylace v lidských buněčných liniích.

---

Návaznosti

GA202/04/0907, projekt VaV	Název: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách Investor: Grantová agentura ČR, Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách
GP202/03/D033, projekt VaV	Název: Vliv metylace a acetylace na strukturu chromatinu Investor: Grantová agentura ČR, Vliv metylace a acetylace na strukturu chromatinu
IAA5004306, projekt VaV	Název: Struktura lidského genomu Investor: Akademie věd ČR, Struktura lidského genomu
MSM 143300002, záměr	Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
NC6987, projekt VaV	Název: Epigeneticky kontrolované změny exprese genů u nádorových onemocnění Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Epigeneticky kontrolované změny exprese genů u nádorových onemocnění
1A8241, projekt VaV	Název: Nové možnosti diagnostiky leukémií s využitím technologie DNA-mikročipů Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Nové možnosti diagnostiky leukémie s využitím technologie DNA-mikročipů