Bacterial DNA isolation using new designed magnetic particles

RITTICH, Bohuslav, Alena ŠPANOVÁ and Kateřina PETROVÁ. Bacterial DNA isolation using new designed magnetic particles. In BioMicroWorld-2005. Badajoz: Formatex Research Center, 2005, p. 1080-1080.

Basic information

• Original name: Bacterial DNA isolation using new designed magnetic particles
• Name in Czech: Izolace bakteriální DNA pomocí nově navržených magnetických částic
• Authors: RITTICH, Bohuslav (203 Czech Republic, guarantor), Alena ŠPANOVÁ (203 Czech Republic) and Kateřina PETROVÁ (203 Czech Republic).
• Edition: Badajoz, BioMicroWorld-2005, p. 1080-1080, 1 pp. 2005.
• Publisher: Formatex Research Center

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Spain
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/05:00015262
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords in English: DNA; isolation; Lactic acid bacteria; magnetic particles
• Tags: DNA, isolation, lactic acid bacteria, magnetic particles
• Tags: International impact

Abstract

Bacterial DNA of the Bifidobacterium and Lactobacillus genera were isolated from complex samples by magnetic carriers containing carboxyl groups on the surface and cobalt ferrite particles modified with different agents. These particles reversibly bind DNA in the presence of poly(ethylene glycol) (PEG 6000) and sodium chloride. A more expressive DNA adsorption was achieved at a PEG concentration > 5% and at a NaCl concentration > 1%. The procedure developed was used for isolation of bacterial DNA from crude cell lysates of different dairy products (butter milk, cheese, yoghurt, probiotic tablets) or from lyophilisates. No phenol extraction of DNA or cell cultivation was necessary. The presence of bacteria of the Bifidobacterium and Lactobacillus genera was identified by PCR amplification.

Abstract (in Czech)

DNA z baktérií rodu Bifidobacterium a Lactobacillus byla izolována z komplexních vzorků pomocí magnetických nosičů obsahujících na povrchu karboxylové skupiny a feritových částic, modifikovaných různými činidly. Uvedené částice reversibilně adsorbují DNA v přítomnosti PEG 6000 a chloridu sodného. Nejvýraznější adsorbce bylo dosaženo při koncentraci PEG 6000 > 5% a NaCl > 1%. vyvinutá metoda byla použita k izolaciDNA z hrubých lyzátů buněk z různých mléčných výrobků (podmáslí,sýr, jogurt, probiotické tablety) a z lyofilizátů. Při izolaci DNA není nutné nepoužívat fenolovou extrakci.Přítomnost bakterií rodu Bifidobacterium a Lactobacillus byla identifikována pomocí PCR.

Links

• QF3169, research and development project: Name: Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů baktérií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin

Investor: Ministry of Agriculture of the CR, The use of procedures on basis of molecular genetics in acquiring of new bacterial strains with probiotic properties with the aim to increase specific genetic sources for production of functional foods

• 1G46045, research and development project: Name: Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů baktérií mléčného kvašení.

Investor: Ministry of Agriculture of the CR, Introduction of new traits for quality and stability improving in variety production of selcted leguminous species by hybridization methods