2004
Complexity and Convergence of Electrostatic and van der Waals Energies within PME and Cutoff Methods
SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka; Jaroslav KOČA a Chang-Guo ZHANZákladní údaje
Originální název
Complexity and Convergence of Electrostatic and van der Waals Energies within PME and Cutoff Methods
Název česky
Složitost a konvergence výpočtu energie elektrostatických a van der Waalsovských interakcí prostřednictvím PME a cutoff metod
Autoři
SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka; Jaroslav KOČA a Chang-Guo ZHAN
Vydání
International Journal of Molecular Sciences, Basel, Switzerland, MDPI Center, 2004, 1422-0067
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10403 Physical chemistry
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14330/04:00011109
Organizační jednotka
Fakulta informatiky
UT WoS
Klíčová slova anglicky
Van der Waals energy; electrostatic energy; convergence of energy; PME
Změněno: 29. 8. 2006 10:42, doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
V originále
In the publication, we studied computational complexity and convergency of PME and cutoff methods. These methods are used for calculation of energy of electrostatic and van der Waals interactions. From results of our analyses, we found following: A choice of a suitable method depends on typeof the molecule. The method PME is effective for nucleic acids, cuttof method for proteins and both methods for oligosacharides.
Česky
V článku byla studována výpočetní složitost a konvergence PME a cutoff metod, sloužících pro výpočet energie elektrostatických a van der Waalsovských interakcí. Z výsledků analýz jsme učinili následující závěry: Volba vhodné metody záleží na typu molekuly. Pro nukleové kyseliny byla vhodnější metoda PME, pro proteiny cutoff metody, v případě oligosacharidů je možno použít obě metody.
Návaznosti
| MSM 143100005, záměr |
|