D 2004

Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins

ŠMAJS, David a Petra MATĚJKOVÁ

Základní údaje

Originální název

Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins

Název česky

Interakce kolicinů U a Y s rekombinantními imunitními proteiny

Název anglicky

Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins

Vydání

Brno, VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. s. 17-17, 2004

Nakladatel

Masarykova univerzita v Brně

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/04:00012098

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

80-210-3321-5

Klíčová slova anglicky

colicin; immunity protein
Změněno: 31. 5. 2005 10:01, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

V originále

Pro identifikaci aminokyselinových zbytků imunitního proteinu kolicinu U a Y interagujících s kolicinem U a Y byly použity dvě základní techniky. První z nich spočívala v konstrukci hybridních proteinů mezi imunitními proteiny kolicinů U a Y a druhý přístup spočíval v cílené mutagenezi genu pro imunitní protein kolicinu U tak, aby změny v aminokyselinové sekvenci odpovídaly sekvenci imunitního proteinu kolicinu Y. Bylo připraveno 16 odlišných hybridních genů pro imunitní protein a 29 konstruktů zahrnujících záměnu 44 odlišných aminokyselinových zbytků (z celkového počtu 54 odlišných). U těchto konstruktů byla testována imunita ke kolicinům U, Y, A, B a N. Imunitní protein kolicinu U je zcela specifický pro kolicin U a nepřináší imunitu proti žádnému jinému testovanému kolicinu. Oproti tomu imunitní protein kolicinu Y přináší jak specifickou imunitu proti kolicinu Y (i když ne tak výraznou jako imunitní protein kolicinu U ke kolicinu U), tak částečnou imunitu ke kolicinu U a A (nikoliv však k sekvenčně příbuzným kolicinům B a N). Aminokyseliny významné pro imunitu ke kolicinu U jsou lokalizovány mezi zbytky 13 - 19 imunitního proteinu. Tyto aminokyseliny jsou lokalizovány v 1. transmembránovém úseku imunitního proteinu. Další interakční místo se předpokládá ve druhém a čtvrtém transmembránovém úseku. U imunitního proteinu kolicinu Y je pravděpodobné, že interakční místo s kolicinem Y tvoří aminokyselinové zbytky druhého a čtvrtého transmembránového úseku, které navzájem spolupracují a kódují imunitu ke kolicinu Y jen tehdy, jsou-li přítomny současně.

Anglicky

Interaction sotes in colicin U and Y immunity proteins were tested using site-directed mutagenesis nad construction oc colicin immunity hybrid molecules. Interactions sites in colicin immunity proteins were identified.

Návaznosti

GA310/03/1091, projekt VaV
Název: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem
Investor: Grantová agentura ČR, Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem