2003
Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem
JANALÍKOVÁ, Magda a David ŠMAJSZákladní údaje
Originální název
Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem
Název česky
Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem
Název anglicky
Hybrid colicin U/Y molecules and their interaction with immunity proteins
Autoři
JANALÍKOVÁ, Magda a David ŠMAJS
Vydání
2003. vyd. Brno, Abstrakta 47. Studentské vědecké konference, s. 12-12, 2003
Nakladatel
Lékařská fakulta MU
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14110/03:00012110
Organizační jednotka
Lékařská fakulta
Klíčová slova anglicky
colicin; immunity protein
Štítky
Změněno: 31. 5. 2005 10:18, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
V originále
V nedávné době byly popsány a molekulárně charakterizovány dva nové koliciny U a Y. Plazmid pColU, který byl identifikován v bakterii Shigella boydii, nese skupinu genů zahrnující gen pro kolicin U, gen pro imunitní protein a gen pro lytický protein. Plazmid pCol-Let, který byl izolován z bakterie E. coli, nese podobnou skupinu genů pro kolicin Y a geny pro imunitní a lytické proteiny. Příbuznost těchto kolicinů je založena na sekvenční podobnosti kolicinů, imunitních proteinů a proteinů lytických. Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y, nejsou producenti obou kolicinů zkříženě imunní. Jednou z možností studia interakce kolicinu s imunitním proteinem je zkoumání letálního účinku hybridních či mutovaných kolicinů (jejichž producenti nejsou zkříženě imunní) na buňky transformované plazmidem nesoucím imunitní protein. Zkonstruovali jsme pět hybridních proteinů kolicinu U/Y a zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu U kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa (34 aminokyselin od C-konce z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách. Navíc jsou připravovány hybridní molekuly imunitních proteinů U/Y, které budou použity pro studium oblastí imunitních proteinů interagujících s koliciny U a Y.
Anglicky
Interaction of colicins with their cognate immunity proteins has been studied. Amino acid residues important for recognition of colicin molecule were found for colicin Y and for colicin U.
Návaznosti
| GA310/03/1091, projekt VaV |
|