J 2006

Evaluation of amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) and species-specific PCR for identification of Bifidobacterium species

KŘÍŽOVÁ, Jana, Alena ŠPANOVÁ a Bohuslav RITTICH

Základní údaje

Originální název

Evaluation of amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) and species-specific PCR for identification of Bifidobacterium species

Název česky

Zavedení restrikční analýzy amplifikované robozomální 16SrDNA (ARDRA) a druhově specifické PCR pro identifikaci druhů rodu Bifidobacterium

Autoři

KŘÍŽOVÁ, Jana (203 Česká republika), Alena ŠPANOVÁ (203 Česká republika) a Bohuslav RITTICH (203 Česká republika, garant)

Vydání

Systematic and Applied Microbiology, 2006, 0723-2020

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Německo

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.037

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00016570

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000235393900006

Klíčová slova anglicky

Bifidobacterium spp.; identification; PCR; ARDRA

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 8. 12. 2006 08:54, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Anotace

ORIG CZ

V originále

Molecular biological methods based on genus and species specific PCR and restriction analysis of two PCR amplicons using six restriction enzymes were used to differentiate among species of Bifidobacterium. Optimalised methods were applied for identification of strains collected in Culture Collection of Dairy Microorganisms. Restriction analysis of longer PCR amplicon was the most discriminative for Bifidobacterium species differentiation. Practicaly observed restriction profiles were compared and confirmed with the theoretical restriction analysis of Bifidobacterium sequences obtained from GenBank database.

Česky

Molekulárně-biologické metody (rodově, druhově specifické PCR a restrikční analýza dvou PCR produktů pomocí šesti restrikčních enzymů) byly použity pro diferenciaci druhů rodu Bifidobacterium.Tyto metody byly následně aplikovány pro identifikaci CCDM kultur. Restrikční analýza delšího amplikonu vykazovala největší diskriminační potenciál a umožnila odlišení mezi příbuznými druhy. Správnost praktické restrikční analýzy byla ověřena teoretickou restrikční analýzou sekvencí získaných z databáze GenBank.

Návaznosti

MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
QF3169, projekt VaV
Název: Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů baktérií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin
Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů bakterií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin
1G46045, projekt VaV
Název: Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů baktérií mléčného kvašení.
Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů bakterií mléčného kvašení