D 2005

CICADA: Parallelization and Related Problems

KOSINA, Aleš; Zdeněk KŘÍŽ a Jaroslav KOČA

Základní údaje

Originální název

CICADA: Parallelization and Related Problems

Název česky

CICADA: Parallelizace a přidružené problémy

Autoři

KOSINA, Aleš; Zdeněk KŘÍŽ a Jaroslav KOČA

Vydání

Praha, Workshop on Modeling Interactions in Biomolecules II, s. 51-51, 2005

Nakladatel

Univerzita Karlova, Praha

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/05:00013942

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

Single Coordinate Driving; Parallelization; Conformational Analysis; result verification
Změněno: 22. 2. 2006 14:12, Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.

Anotace

V originále

CICADA programme is based on SCD (Single Coordinate Driving) approach and is used for a comformational analysis and molecular docing of small and middle sized molecules. CICADA programme was parallelized in Master-Slave approach. The programme were extensively tested for the correctness on different computer environment and is showen result independece on number of CPU and eviroment.

Česky

Program CICADA je postaven na SCD (Single Coordinate Driving) přístupu a je používán pro konformační analýzu malých a středních molekula a pro molekulární docking. Program CICADA byl paralelizován pomocí Master-Slave přístupu. Program byl velmi intenzivně testován na různých výpočetních prostředích a výsledky ukazují nezávislot výpočtů na použitém prostředí a počtu procesorů.

Návaznosti

MSM 143100005, záměr
Název: Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím