D 2005

Study of Fluorescently Labelled Peptides and Small Proteins Using Capillary Electrophoresis Combined with Laser Induced Fluorescence and MALDI MS Detection

VRÁBEL, Patrik, Petr TÁBORSKÝ, Markéta RYVOLOVÁ, Helena ŘEHULKOVÁ, Josef HAVEL et. al.

Základní údaje

Originální název

Study of Fluorescently Labelled Peptides and Small Proteins Using Capillary Electrophoresis Combined with Laser Induced Fluorescence and MALDI MS Detection

Název česky

Studium fluorescenčně značených peptidů a malých proteinů pomocí kapilární elektroforézy s laserem indukovanou detekcí kombinovanou s hmotnostní spektrometrií MALDI.

Autoři

VRÁBEL, Patrik (203 Česká republika, garant, domácí), Petr TÁBORSKÝ (203 Česká republika, domácí), Markéta RYVOLOVÁ (203 Česká republika, domácí), Helena ŘEHULKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Josef HAVEL (203 Česká republika, domácí) a Jan PREISLER (203 Česká republika, domácí)

Vydání

8. vyd. Praha, Collection Symposium Series, Biollogicaly Active Peptides, od s. 103-106, 4 s. 2005

Nakladatel

Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10406 Analytical chemistry

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Odkazy

Kód RIV

RIV/00216224:14310/05:00012704

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

80-86241-26-2

Klíčová slova anglicky

Derivatization; Fluorescent labelling; Capillary Electrophoresis; MALDI Mass Spectrometry; Peptides and Proteins
Změněno: 11. 4. 2013 16:30, prof. Mgr. Jan Preisler, Ph.D.

Anotace

V originále

In this work, we apply CE-LIF, CE-UV and CE - Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI TOFMS) to investigate derivatization of model peptides and small proteins with rhodamine-based fluorescent reagents, which are compatible with the wavelength of frequency doubled diode pumped Nd:YAG excitation laser (532 nm). While the LIF detection mode is needed for sensitive detection, the MALDI TOFMS analysis can reveal the mass of analytes. Both derivatized and non-derivatized peptides and proteins, the number of fluorescent labels per peptide/proteins and other product of derivatization process can be detected directly from reaction mixtures or after separation. Thus, MALDI TOFMS serves for additional identification of peaks present in CELIF or CEUV electropherograms. For off-line coupling of CE with MALDI MS, subatmospheric deposition interface was used. An examples of final sensitive CELIF separation of derivatized peptides and small proteins are given. Main advantages and disadvantages of LIF, absorbance and MS detector for capillary electrophoresis of polypeptides are disscused. Attention is paid to detection limits in practical analysis.

Česky

V této práci aplikujeme metody CELIF, CEUV a CE-MALDITOF MS pro analýzu modelových peptidů a proteinů derivatizovaných fluorescenčními barvivy založenými na rhodaminu. Fluorescence připravených rhodaminových derivátů je excitovatelná snadno dostupným pevnolátkovým laserem - diodově pumpovaným Nd:YAG s dvojitě násobenou frekvencí a vlnovou délkou 532 nm. Laserem indukovaná fluorescenční detekce umožňuje velmi citlivé stanovení látek. Podmínkou aplikovatelnosti metody je však dobrá optimalizace celého postupu derivatizace a spolehlivá identifikace elektroferogramu z metody CELIF nebo CEUV. K tomuto účelu je využito laboatorně sestavená konstrukce pro kombinaci CE s hmotnostně spektrometrickou detekcí MALDITOF. V práci jsou na separacích derivatizovaných směsí peptidů a malých proteinů demonstrovány možnosti derivatizace pro 532 nm LIF detektor, a je diskutována citlivost stanovení reálných analytů včetně porovnání s metodou CE bez použití derivatizace a LIF detekce.

Návaznosti

GA203/03/0515, projekt VaV
Název: Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie
Investor: Grantová agentura ČR, Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací