Úvod do analýzy a designu DNA microarrays

D 2005

Úvod do analýzy a designu DNA microarrays

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ a Ladislav DUŠEK

Základní údaje

Originální název

Úvod do analýzy a designu DNA microarrays

Název česky

Úvod do analýzy a designu DNA microarrays

Název anglicky

Introduction into study design and data analysis of DNA microarrays

Autoři

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ a Ladislav DUŠEK

Vydání

Brno, Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. od s. 99-100, 2 s. 2005

Nakladatel

Česká společnosti pro analytickou cytologii

Další údaje

Jazyk

slovenština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

80-239-5155-6

Klíčová slova anglicky

microarrays; design; analysis

Štítky

analysis, design, microarrays

Změněno: 30. 4. 2006 23:25, Mgr. Eva Budinská, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ EN

V originále

Technika microarrays je v dnešnej dobe jednou z najperspektívnejších metód využívaných pre analýzu genómu. Microarray technológia dovoľuje súčasnú analýzu tisícov parametrov v rámci jedného experimentu. Na základe predmetu skúmania sa dajú microarrays zjednodušene rozdeliť na: 1. CGH microarrays - pomocou microarray technológie sa odhaľujú zmeny v počte kópií génov alebo chromozómov (tzv. copy number changes), teda sa analyzuje priamo DNA. Základnou technikou je Komparatívna genómová hybridizácia (CGH). 2. Expresné microarrays - sleduje sa úroveň expresie jednotlivých génov na úrovni mRNA. 3. Proteínové microarrays jedno z najnovších využití microarray technológie, sledujú sa zmeny na úrovni proteínov. Analýza proteínových microarrays je odlišná technológiou i následnou analýzou. Na základe toho aký cieľ sme experimentu vytýčili sa stanovuje jeho celkový design. Do celkového designu experimentu patrí ako odhad počtu potrebných microarray čipov a pacientov tak aj výber vhodného microarray designu (loop, referenčný, balancovaný).

Česky

Neznámý popis výsledku

Anglicky

Unknown description

Návaznosti

1ET208120511, projekt VaV

Název: Implementace a validace robustního znalostního analytického systému UIRON pro oblast onkologie

Investor: Akademie věd ČR, Implementace a validace robustního analytického systému UIRON pro oblast onkologie

Citovat

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ a Ladislav DUŠEK. Úvod do analýzy a designu DNA microarrays. In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. Brno: Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005, s. 99-100. ISBN 80-239-5155-6.

@inproceedings{584101,
   author = {Budinská, Eva and Jarkovský, Jiří and Dušek, Ladislav},
   address = {Brno},
   booktitle = {Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III.},
   keywords = {microarrays; design; analysis},
   language = {sla},
   location = {Brno},
   isbn = {80-239-5155-6},
   pages = {99-100},
   publisher = {Česká společnosti pro analytickou cytologii},
   title = {Úvod do analýzy a designu DNA microarrays},
   year = {2005}
}

TY  - JOUR
ID  - 584101
AU  - Budinská, Eva - Jarkovský, Jiří - Dušek, Ladislav
PY  - 2005
TI  - Úvod do analýzy a designu DNA microarrays
PB  - Česká společnosti pro analytickou cytologii
CY  - Brno
SN  - 8023951556
KW  - microarrays
KW  - design
KW  - analysis
N2  - Technika microarrays je v dnešnej dobe jednou z najperspektívnejších metód využívaných pre analýzu genómu. Microarray technológia dovoľuje súčasnú analýzu tisícov parametrov v rámci jedného experimentu. Na základe predmetu skúmania sa dajú microarrays zjednodušene rozdeliť na: 1. CGH microarrays - pomocou microarray technológie sa odhaľujú zmeny v počte kópií génov alebo chromozómov (tzv. copy number changes), teda sa analyzuje priamo DNA. Základnou technikou je Komparatívna genómová hybridizácia (CGH). 2. Expresné microarrays - sleduje sa úroveň expresie jednotlivých génov na úrovni mRNA. 3. Proteínové microarrays jedno z najnovších využití microarray technológie, sledujú sa zmeny na úrovni proteínov. Analýza proteínových microarrays je odlišná technológiou i následnou analýzou. Na základe toho aký cieľ sme experimentu vytýčili sa stanovuje jeho celkový design. Do celkového designu experimentu patrí ako odhad počtu potrebných microarray čipov a pacientov tak aj výber vhodného microarray designu (loop, referenčný, balancovaný).
ER  -

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ a Ladislav DUŠEK. Úvod do analýzy a designu DNA microarrays. In \textit{Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III.}. Brno: Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005, s.~99-100. ISBN~80-239-5155-6.

Podrobný výpis o publikaci