CGH microarrays: detekcia

D 2005

CGH microarrays: detekcia "zlomov" v genóme

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ and Ladislav DUŠEK

Basic information

Original name

CGH microarrays: detekcia "zlomov" v genóme

Name in Czech

CGH microarraye: detekce zlomů v genomu.

Name (in English)

arrayCGH : detection of breakpoints in the genome.

Authors

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ and Ladislav DUŠEK

Edition

Brno, Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. p. 103-104, 2 pp. 2005

Publisher

Česká společnosti pro analytickou cytologii

Other information

Language

Slovak

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10103 Statistics and probability

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

80-239-5155-6

Keywords in English

CGH; microarrays; breakpoint detection

Abstract

ORIG CZ EN

V originále

CGH microarrays je pomerne nová, v súčasnosti široko uplatňovaná technológia analýzy genómu. Pomocou nej sa odhaľujú zmeny v počte kópií génov alebo chromozómov (tzv. copy number changes), prípadne iné chromozómové prestavby, teda sa analyzuje priamo DNA. Základnou využívanou metódou porovnávania je komparatívna genómová hybridizácia (CGH). Keďže zmeny v počte kópií génov (napr. u nádorov) zasahujú väčšinou širšie oblasti DNA, môžeme očakávať, že jednotlivé zmeny budú aj graficky viditeľné v podobe segmentov. Časti, ktoré tieto segmenty oddeľujú sa nazývajú zlomy a úlohou väčšiny štatistických metód pre analýzu CGH arrayí je tieto zlomy čo najpresnejšie detekovať. Časti, ktoré tieto segmenty oddeľujú sa nazývajú zlomy a úlohou väčšiny metód je tieto zlomy čo najpresnejšie detekovať. Gény, ktoré tieto segmenty tvoria spolu susedia, teda sú priestorovo závislé. Túto priestorovú informáciu je výhodné pri hľadaní chromozómových aberácií využiť, pretože redukuje šum a zvyšuje dôveryhodnosť detekovaných zmien. Metódy ktoré túto informáciu využívajú sa teda odlišujú od klasických techník využívaných pri analýze expresných microarrays.

In Czech

Neznámý popis výsledku

In English

Unknown description

Links

1ET208120511, research and development project

Name: Implementace a validace robustního znalostního analytického systému UIRON pro oblast onkologie

Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Implementation and validation of robust knowledge management and analytical system UIRON for oncology

Citovat

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ and Ladislav DUŠEK. CGH microarrays: detekcia "zlomov" v genóme (arrayCGH : detection of breakpoints in the genome.). In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. Brno: Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005, p. 103-104. ISBN 80-239-5155-6.

@inproceedings{584102,
   author = {Budinská, Eva and Jarkovský, Jiří and Dušek, Ladislav},
   address = {Brno},
   booktitle = {Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III.},
   keywords = {CGH; microarrays; breakpoint detection},
   language = {sla},
   location = {Brno},
   isbn = {80-239-5155-6},
   pages = {103-104},
   publisher = {Česká společnosti pro analytickou cytologii},
   title = {CGH microarrays: detekcia "zlomov" v genóme},
   year = {2005}
}

TY  - JOUR
ID  - 584102
AU  - Budinská, Eva - Jarkovský, Jiří - Dušek, Ladislav
PY  - 2005
TI  - CGH microarrays: detekcia "zlomov" v genóme
PB  - Česká společnosti pro analytickou cytologii
CY  - Brno
SN  - 8023951556
KW  - CGH
KW  - microarrays
KW  - breakpoint detection
N2  - CGH microarrays je pomerne nová, v súčasnosti široko uplatňovaná technológia analýzy genómu. Pomocou nej sa odhaľujú zmeny v počte kópií génov alebo chromozómov (tzv. copy number changes), prípadne iné chromozómové prestavby, teda sa analyzuje priamo DNA. Základnou využívanou metódou porovnávania je komparatívna genómová hybridizácia (CGH). Keďže zmeny v počte kópií génov (napr. u nádorov) zasahujú väčšinou širšie oblasti DNA, môžeme očakávať, že jednotlivé zmeny budú aj graficky viditeľné v podobe segmentov. Časti, ktoré tieto segmenty oddeľujú sa nazývajú zlomy a úlohou väčšiny štatistických metód pre analýzu CGH arrayí je tieto zlomy čo najpresnejšie detekovať. Časti, ktoré tieto segmenty oddeľujú sa nazývajú zlomy a úlohou väčšiny metód je tieto zlomy čo najpresnejšie detekovať. Gény, ktoré tieto segmenty tvoria spolu susedia, teda sú priestorovo závislé. Túto priestorovú informáciu je výhodné pri hľadaní chromozómových aberácií využiť, pretože redukuje šum a zvyšuje dôveryhodnosť detekovaných zmien. Metódy ktoré túto informáciu využívajú sa teda odlišujú od klasických techník využívaných pri analýze expresných microarrays.
ER  -

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ and Ladislav DUŠEK. CGH microarrays: detekcia ''zlomov'' v genóme (arrayCGH : detection of breakpoints in the genome.). In \textit{Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III.}. Brno: Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005, p.~103-104. ISBN~80-239-5155-6.

Detailed Information on Publication Record