Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@inproceedings{584102,
author = {Budinská, Eva and Jarkovský, Jiří and Dušek, Ladislav},
address = {Brno},
booktitle = {Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III.},
keywords = {CGH; microarrays; breakpoint detection},
language = {sla},
location = {Brno},
isbn = {80-239-5155-6},
pages = {103-104},
publisher = {Česká společnosti pro analytickou cytologii},
title = {CGH microarrays: detekcia "zlomov" v genóme},
year = {2005}
}
TY - JOUR
ID - 584102
AU - Budinská, Eva - Jarkovský, Jiří - Dušek, Ladislav
PY - 2005
TI - CGH microarrays: detekcia "zlomov" v genóme
PB - Česká společnosti pro analytickou cytologii
CY - Brno
SN - 8023951556
KW - CGH
KW - microarrays
KW - breakpoint detection
N2 - CGH microarrays je pomerne nová, v súčasnosti široko uplatňovaná technológia analýzy genómu. Pomocou nej sa odhaľujú zmeny v počte kópií génov alebo chromozómov (tzv. copy number changes), prípadne iné chromozómové prestavby, teda sa analyzuje priamo DNA. Základnou využívanou metódou porovnávania je komparatívna genómová hybridizácia (CGH). Keďže zmeny v počte kópií génov (napr. u nádorov) zasahujú väčšinou širšie oblasti DNA, môžeme očakávať, že jednotlivé zmeny budú aj graficky viditeľné v podobe segmentov. Časti, ktoré tieto segmenty oddeľujú sa nazývajú zlomy a úlohou väčšiny štatistických metód pre analýzu CGH arrayí je tieto zlomy čo najpresnejšie detekovať. Časti, ktoré tieto segmenty oddeľujú sa nazývajú zlomy a úlohou väčšiny metód je tieto zlomy čo najpresnejšie detekovať. Gény, ktoré tieto segmenty tvoria spolu susedia, teda sú priestorovo závislé. Túto priestorovú informáciu je výhodné pri hľadaní chromozómových aberácií využiť, pretože redukuje šum a zvyšuje dôveryhodnosť detekovaných zmien. Metódy ktoré túto informáciu využívajú sa teda odlišujú od klasických techník využívaných pri analýze expresných microarrays.
ER -
BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ and Ladislav DUŠEK. CGH microarrays: detekcia ''zlomov'' v genóme (arrayCGH : detection of breakpoints in the genome.). In \textit{Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III.}. Brno: Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005, p.~103-104. ISBN~80-239-5155-6.
|
