OTYEPKA, Michal, Iveta BÁRTOVÁ, Zdeněk KŘÍŽ a Jaroslav KOČA. Dynamika regulačních enzymů buněčných procesů CDK2 a CDK5 studovaná molekulovou dynamikou. In ChemZi. Bratislava: Slovenská chemická spoločnosť, 2005, s. 277-277. ISBN 1336 - 7242.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Dynamika regulačních enzymů buněčných procesů CDK2 a CDK5 studovaná molekulovou dynamikou
Název česky Dynamika regulačních enzymů buněčných procesů CDK2 a CDK5 studovaná molekulovou dynamikou
Název anglicky Dynamics of human CDK2 and CDK5 studied by computer simulations
Autoři OTYEPKA, Michal (203 Česká republika, garant), Iveta BÁRTOVÁ (203 Česká republika), Zdeněk KŘÍŽ (203 Česká republika) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika).
Vydání Bratislava, ChemZi, od s. 277-277, 1 s. 2005.
Nakladatel Slovenská chemická spoločnosť
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10403 Physical chemistry
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 1336 - 7242
Klíčová slova anglicky Molecular dynamics; CDK2; CDK5; phosphorylation; regulation mechanism
Štítky CDK2, CDK5, molecular dynamics, phosphorylation, regulation mechanism
Změnil Změnila: Mgr. Iveta Bártová, Ph.D., učo 15185. Změněno: 14. 11. 2005 09:37.
Anotace
Cyklin-dependentní kinázy (CDK) jsou enzymy podílející se na regulaci řady významných buněčných procesů např. buněčného cyklu, apoptózy, diferenciace neuronálních buněk atp. CDK sestvají ze dvou podjednotek, katalytické podjednotky, kinázy a regulační podjednotky, cyklinu. Aktivita těchto enzymů je na molekulární úrovni zvýšena vazbou cyklinu a fosforylací aktivačních míst popř. defosforylací inhibičních míst. Jediný člen rodiny CDK a to CDK5 z tohoto schématu vybočuje, navzdory jeho vysoké homologii (60%) s CDK2 a dalšími enzymy z rodiny CDK. CDK5 není aktivována cyklinem ale regulačním enzymem p35 resp. p39 a navíc je tento komplex plně aktivní a nevyžaduje další aktivaci fosforylací, jako je tomu u ostatních CDK [1-3]. Navíc se ukazuje, že fosforylace v glycinové smyčce (G-smyčce), která je pro CDK2 inhibiční, je pro CDK5 stimulační [4]. Strukturní aspekty regulace fosforylací G-smyky byly nedávno odhaleny molekulovou dynamikou (MD) [5, 6]. O mechanismu aktivace fosforylací v G-smyčce CDK5 nedávno spekuloval v literatue Mapelli a kol. [3] a to zejména s ohledem na vazbu inhibitoru roskovitinu v aktivním místě enzymu. Příspěvek bude diskutovat rozdíly v interakčních energiích inhibitoru s CDK2 resp. CDK5 a dále rozdíly v interakcích mezi CDK a její regulační podjednotkou s cílem pochopit, rozdílný mechanismus regulace CDK5.
Anotace anglicky
Dynamics of human CDK2 and CDK5 studied by computer simulations
Návaznosti
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 19. 9. 2024 15:09