2005
Influence of Ion Parameters On Molecular Dynamics and/or Free Energy Calculation
FADRNÁ, Eva, Jaroslav KOČA a Jiří ŠPONERZákladní údaje
Originální název
Influence of Ion Parameters On Molecular Dynamics and/or Free Energy Calculation
Název česky
Vliv parametrů iontů na výpočet molekulové dynamiky a/nebo volné energie
Autoři
FADRNÁ, Eva (203 Česká republika, garant), Jaroslav KOČA (203 Česká republika) a Jiří ŠPONER (203 Česká republika)
Vydání
Praha, Workshop on Modelling interactions in Biomolecules II, od s. O, 1 s. 2005
Nakladatel
Karlova Univerzita Praha
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10610 Biophysics
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/05:00014159
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
molecular dynamics simulations; human telomere; free energy
Změněno: 18. 11. 2005 12:44, Mgr. Eva Fadrná, Ph.D.
V originále
Molecular modeling studies of DNA quadruplexes by means of several computational approaches including ns-scale MD simulation, Locally Enhanced Sampling and MM-PBSA. Simple model of ion description influences entire potential energy surface and may shift the molecule from experimental geometry. A lot of attention should be paid to force-field adjustment in order to reach true picture of the structure.
Česky
Molecular modeling studies of DNA quadruplexes by means of several computational approaches including ns-scale MD simulation, Locally Enhanced Sampling and MM-PBSA. Simple model of ion description influences entire potential energy surface and may shift the molecule from experimental geometry. A lot of attention should be paid to force-field adjustment in order to reach true picture of the structure.
Návaznosti
| MSM0021622413, záměr |
|