D 2005

Isolation of PCR-ready DNA from Mycobacterial cells using magnetic particles

TĚŠÍNSKÁ, Iva, Bohuslav RITTICH, Alena ŠPANOVÁ a Milan BARTOŠ

Základní údaje

Originální název

Isolation of PCR-ready DNA from Mycobacterial cells using magnetic particles

Název česky

Izolace mykobakteriální DNA v kvalitě pro PCR pomocí magnetických částic

Autoři

TĚŠÍNSKÁ, Iva (203 Česká republika), Bohuslav RITTICH (203 Česká republika, garant), Alena ŠPANOVÁ (203 Česká republika) a Milan BARTOŠ (203 Česká republika)

Vydání

Pardubice, Česká republika, 11th International Symposium on Separation Sciences ISSS 2005, od s. 299-299, 1 s. 2005

Nakladatel

Univerzita Pardubice

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/05:00012824

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

80-7194-771-7

Klíčová slova anglicky

Mycobacterium; DNA; PCR

Štítky

Změněno: 23. 11. 2006 08:51, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Anotace

V originále

For this study, chicken erythrocyte DNA and calf liver RNA were used. For both types of nucleic acids, we compared the binding capacity of the following particles: non-magnetic particles based on silica, magnetic particles based on ferrite, and magnetic particles P(HEMA-co-GMA) microspheres covered with carboxylic groups. A binding buffer containing 8% PEG and 2M NaCl (final concentration) was shown to be the most appropriate combination for further studies. Separated DNA was eluted using TE buffer. The knowledge acquired was used for the development of a PCR-ready mycobacterial DNA isolation technique. Mycobacterial DNA from the eluate was detected by amplification of the dnaJ gene. The primers Multidnajf and MultidnaJr amplify a product 140 bp long. The sensitivity of the reaction is 5 . 10-3 ng/ul (5.95. 10+2 copies).

Česky

Byly stanoveny vazebné kapacity DNA z kuřecích erythrocytů a RNA z hovězích jater na následující částice: silikagel, magnetické feritové částice a magnetické P(HEMA-co-GMA)mikročástice obsahující karboxylové skupiny. Jako nejvhodnější vazebný pufr byl zjištěn 8% PEG a 2M NaCl (konečná koncentrace). Z částic byla DNA eluována pomocí TE pufru. Získané znalosti byly využity při izolaci mykobakteriální DNA v kvalitě vhodné pro PCR. Mykobakteriální DNA byla detekována amplifikací genu dnaj. Pomocí primerů Multidnajf a MultidnaJr byl amplifikován produkt o velikosti 140 bp. Citlivost stanovení byla 5,0 x 10-3 ng/ul (5,95 x 10+2 kopií buněk).

Návaznosti

GA203/05/2256, projekt VaV
Název: Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
Investor: Grantová agentura ČR, Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
MZE0002716201, záměr
Název: Zdravá zvířata a bezpečné potraviny jako základ pro zdraví lidí