J 2006

Effect of Solvation on Pinched Cone-Pinched Cone Interconversion of Tetraethoxycalix[4]arene and Tetraethoxythiacalix[4]arene

MATOUŠEK, Jiří; Petr KULHÁNEK; Michal ČAJAN a Jaroslav KOČA

Základní údaje

Originální název

Effect of Solvation on Pinched Cone-Pinched Cone Interconversion of Tetraethoxycalix[4]arene and Tetraethoxythiacalix[4]arene

Název česky

Role solventu v pinched cone - pinched cone interkonverzi tetraethoxycalix[4]arenu a tetraethoxythiacalix[4]arenu

Autoři

MATOUŠEK, Jiří; Petr KULHÁNEK; Michal ČAJAN a Jaroslav KOČA

Vydání

Journal of Physical Chemistry A, 2006, 1089-5639

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10403 Physical chemistry

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 3.047

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00015290

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

Klíčová slova anglicky

calixarene; calix[4]arene; molecular dynamics; force field; free energy calculations; solvent

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 14. 2. 2007 15:16, prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.

Anotace

ORIG CZ

V originále

The pinched cone-pinched cone interconversion (PCI) of tetraethoxy substituted calix[4]arene and thiacalix[4]arene was studied by means of molecular dynamics using the GAFF force field and quantum mechanics. Influence of solvent was expressed by changes in cavity geometries as well as in free energy barriers that were calculated using constrained MD simulations. Water and chloroform were found to reduce the energy barriers in comparison with vacuum simulations. Only qualitative agreement between energy barriers calculated by MD and experimental values was achieved. Also, quantum chemical calculations were performed with the RI-MP2 method, and a better description of PCI was achieved than that previously obtained by HF or DFT methods. The combination of qualitative MD data on solvated systems with RI-MP2 gas-phase data gave us very good agreement with experimental results.

Česky

Interkonverze calix[4]arenu

Návaznosti

GD204/03/H016, projekt VaV
Název: Strukturní biofyzika makromolekul
Investor: Grantová agentura ČR, Strukturní biofyzika makromolekul
IAA400200503, projekt VaV
Název: Léčiva na bázi sacharidů a calixarenů - design, struktura, protinádorová a protivirová aktivita
Investor: Akademie věd ČR, Léčiva na bázi sacharidů a calixarenů – design, struktura, protinádorová a protivirová aktivita
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím