MATOUŠEK, Jiří, Petr KULHÁNEK, Michal ČAJAN a Jaroslav KOČA. Effect of Solvation on Pinched Cone-Pinched Cone Interconversion of Tetraethoxycalix[4]arene and Tetraethoxythiacalix[4]arene. Journal of Physical Chemistry A. 2006, roč. 110, č. 3, s. 861-867. ISSN 1089-5639.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Effect of Solvation on Pinched Cone-Pinched Cone Interconversion of Tetraethoxycalix[4]arene and Tetraethoxythiacalix[4]arene
Název česky Role solventu v pinched cone - pinched cone interkonverzi tetraethoxycalix[4]arenu a tetraethoxythiacalix[4]arenu
Autoři MATOUŠEK, Jiří (203 Česká republika), Petr KULHÁNEK (203 Česká republika), Michal ČAJAN (203 Česká republika) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika, garant).
Vydání Journal of Physical Chemistry A, 2006, 1089-5639.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10403 Physical chemistry
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.047
Kód RIV RIV/00216224:14310/06:00015290
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000235046100004
Klíčová slova anglicky calixarene; calix[4]arene; molecular dynamics; force field; free energy calculations; solvent
Štítky calixarene, calix[4]arene, force field, free energy calculations, molecular dynamics, SOLVENT
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 14. 2. 2007 15:16.
Anotace
The pinched cone-pinched cone interconversion (PCI) of tetraethoxy substituted calix[4]arene and thiacalix[4]arene was studied by means of molecular dynamics using the GAFF force field and quantum mechanics. Influence of solvent was expressed by changes in cavity geometries as well as in free energy barriers that were calculated using constrained MD simulations. Water and chloroform were found to reduce the energy barriers in comparison with vacuum simulations. Only qualitative agreement between energy barriers calculated by MD and experimental values was achieved. Also, quantum chemical calculations were performed with the RI-MP2 method, and a better description of PCI was achieved than that previously obtained by HF or DFT methods. The combination of qualitative MD data on solvated systems with RI-MP2 gas-phase data gave us very good agreement with experimental results.
Anotace česky
Interkonverze calix[4]arenu
Návaznosti
GD204/03/H016, projekt VaVNázev: Strukturní biofyzika makromolekul
Investor: Grantová agentura ČR, Strukturní biofyzika makromolekul
IAA400200503, projekt VaVNázev: Léčiva na bázi sacharidů a calixarenů - design, struktura, protinádorová a protivirová aktivita
Investor: Akademie věd ČR, Léčiva na bázi sacharidů a calixarenů – design, struktura, protinádorová a protivirová aktivita
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 27. 7. 2024 14:50