a 2005

Community-level physiological profiles of soil bacteria - statistical analysis

ŠVIHÁLEK, Jiří, Jakub HOFMAN, Klára KUBOŠOVÁ a Ladislav DUŠEK

Základní údaje

Originální název

Community-level physiological profiles of soil bacteria - statistical analysis

Název česky

Stanovení funkční diverzity půdních mikroorganismů - statistcká analýza

Autoři

ŠVIHÁLEK, Jiří (203 Česká republika), Jakub HOFMAN (203 Česká republika, garant), Klára KUBOŠOVÁ (203 Česká republika) a Ladislav DUŠEK (203 Česká republika)

Vydání

ECOTOX 2005 "Advances and Trends in Ecotoxicology" BOOK OF ABSTRACTS, 2005

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10511 Environmental sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/05:00014600

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

80-210-3799-7

Klíčová slova anglicky

CLPP; Soil bacteria; PCA

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 24. 2. 2010 21:57, prof. RNDr. Jakub Hofman, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

The aim of this work was to suggest analytical approaches for assessment of community-level physiological profiles (CLPP) of soil microorganisms determined by BIOLOG method. For demonstration of analytical approaches 4 soils with known biology and physical-chemistry properties were used. Shannon-Weaver diversity index , evenness, principal component analysis and cluster analysis were used to assess CLPP. Evaluting parameters were trapezoid areas under the curve (TA) and values of absorbance after 48 and 72 hours of incubation. As the result T-TA was choosen as the most sensitive parameter for CLPP assessment. The distribution of soils evaluted by T-TA corresponded with their biology and physical-chemistry properties. Interpretation of CLPP data requires information from all of analytical methods used. This would be a manual for rutine evaluating of CLPP.

Česky

Cílem této práce je navrhnout postup pro hodnocení fyziologického profilu společenstva půdních mikroorganismů (CLPP) stanoveného metodou BIOLOG. Pro hodnocení byl použit Shannon-Weaverův index diverzity, evenness, analýza hlavních komponent a shluková analýza. Tyto metody jsou v literatuře používány nejčastěji. Pro hodnocení byly zvoleny 3 parametry: plocha pod křivkou (TA) a hodnoty absorbance ve 48. a 72. hodině inkubace. Celý postup hodnocení dat včetně standardizace hustoty inokula byl demonstrován na hodnocení 4 reálných půd, u kterých byly známy biologické a fyzikálně-chemické vlastnosti. Nejcitlivějším parametrem pro hodnocení se v této práci ukázal parametr TA spočítaný ze standardizovaných dat (T-TA). Hodnocením CLPP pomocí všech zkoumaných metod a propojením jejich výsledků v jeden celek došlo k rozdělení 4 zkoumaných půd. Toto rozdělení odpovídalo rozdělení půd podle biologických a fyzikálně-chemických vlastností. Na základě všech těchto znalostí byly diskutovány příčiny rozdělení půd dle CLPP. Funkční diverzita stanovená metodou BIOLOG (dle nejcitlivějšího parametru T-TA) dává dobrou informaci o stavu půdních mikroorganismů. Je ale třeba dále konfrontovat výsledky s ostatními mikrobiálními parametry a vlastnostmi půdy pro získání komplexního pohledu na zkoumanou lokalitu.

Návaznosti

MSM0021622412, záměr
Název: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Akronym: INCHEMBIOL)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni