a 2005

Studium domnělých regulátorů genové exprese spirochety Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ, Darina a David ŠMAJS

Základní údaje

Originální název

Studium domnělých regulátorů genové exprese spirochety Treponema pallidum.

Název anglicky

Putative gene regulators in Treponema pallidum

Autoři

Vydání

Abstrakta 49. Studenstské vědecké konference, 2005

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/05:00013194

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

Treponema pallidum subsp. pallidum; gene expression profiling; BAC clones

Štítky

Změněno: 8. 4. 2010 17:36, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Cíl: Ověřit funkčnost domnělých regulátorů RpoN (54) a FhlA a stanovit spektrum genů těmito regulátory ovlivňovaných. Identifikovat 54 závislé promotory. Materiál a metody: T. pallidum nelze kultivovat v podmínkách in vitro, expresi treponemálních genů jsme tedy monitorovali v 19 klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Gen rpoN (kódující 54 faktor) a fhlA (kódující domnělý transkripční faktor) byly naklonovány do expresních arabinózou indukovatelných plazmidů pBAD/HisB, které jsou kompatibilní s replikačním systémem kosmidu BAC. Závěr: Proteiny RpoN a FhlA jsou pozitivní regulátory genové exprese a ovlivňují transkripci genů spřažených s mnoha buněčnými procesy.

Anglicky

Genes rpoN (coding for 54 factor) and fhlA (coding for putative transcriptional activator) were cloned into the arabinose-inducible expression vector pBAD/HisB. Q-PCR technique was used for the study of putative gene regulation mediated by RpoN and FhlA in the clones of the BAC library. 54-dependent promoters were identified in the T. pallidum genome using in silico approach and the predicted transcripts were mapped by PCR technique. Proteins RpoN and FhlA are positive regulators of gene expression of several treponemal genes.

Návaznosti

GA310/04/0021, projekt VaV
Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NI7351, projekt VaV
Název: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice