ŠMAJS, David, Petra MATĚJKOVÁ, Michal STROUHAL, S.J. NORRIS a G.M. WEINSTOCK. Comparing genomes of pathogenic and non-pathogenic spirochetes: DNA-microarray hybridizations, whole genome fingerprinting and DNA sequencing. In Abstract Book of NATO Advanced Research Workshop on Molecular Biology of Spirochetes. 2005.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Comparing genomes of pathogenic and non-pathogenic spirochetes: DNA-microarray hybridizations, whole genome fingerprinting and DNA sequencing.
Název česky Srovnání genomů patogenních a nepatogenních spirochet pomocí DNA-microarray hybridizace, whole genome fingerprintingu a DNA sekvenování.
Autoři ŠMAJS, David (203 Česká republika, garant), Petra MATĚJKOVÁ (203 Česká republika), Michal STROUHAL (203 Česká republika), S.J. NORRIS (840 Spojené státy) a G.M. WEINSTOCK (840 Spojené státy).
Vydání Abstract Book of NATO Advanced Research Workshop on Molecular Biology of Spirochetes, 2005.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14110/05:00013211
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Klíčová slova anglicky Treponema pallidum ssp. pallidum; Treponema pallidum ssp. pertenue; Treponema paraluiscuniculi
Štítky Treponema pallidum ssp. pallidum, Treponema pallidum ssp. pertenue, Treponema paraluiscuniculi
Změnil Změnil: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Změněno: 8. 4. 2010 15:52.
Anotace
Genomes of closely related treponemes, Treponema pallidum ssp. pallidum (strains Nichols and SS14) and Treponema pallidum ssp. pertenue (Samoan D) were compared with the genome of Treponema paraluiscuniculi (strain Cuniculi A) using comparative genomic techniques. T. pallidum ssp. pallidum is the causative agent of highly invasive human disease syphilis, T. pallidum ssp. pertenue is the causative agent of yaws and T. paraluiscuniculi is not pathogenic to humans. When compared to Nichols genome, 1, 8 and 34 differences in the BamH I target restriction sites and 3, 7 and 20 indels were found in the genome of SS14, Samoan D and T. paraluiscuniculi, respectively.
Anotace česky
Genomy blízce příbuzných treponem, Treponema pallidum ssp. pallidum (kmenů Nichols a SS14) a Treponema pallidum ssp. pertenue (Samoan D) byly porovnány s genomem Treponema paraluiscuniculi (kmenCuniculi A) s použitím technik komparativní genomiky. Ve srovnání s kmenem Nichols jsme nalezli, 1, 8 a 34 změn pro cílovou sekvenci restriktázy BamH I a 3, 7 a 20 inzercí a delecí v genomech SS14, Samoan D a T. paraluiscuniculi.
Návaznosti
GA310/04/0021, projekt VaVNázev: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NI7351, projekt VaVNázev: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice
VytisknoutZobrazeno: 11. 5. 2024 23:21