J 2007

Dynamics of nuclear transcription autoregulation: Bifurcation and periodic solutions in a negative feedback loop with delay

POKOJSKÁ, Eva a Rachid OUIFKI

Základní údaje

Originální název

Dynamics of nuclear transcription autoregulation: Bifurcation and periodic solutions in a negative feedback loop with delay

Název česky

Dynamika autoregulace jaderné transkripce: Bifurkace a periodická řešení v negativní zpětnovazebné smyčce se zpožděním

Autoři

POKOJSKÁ, Eva a Rachid OUIFKI

Vydání

Physica D - Nonlinear Phenomena, North-Holland, Elsevier, 2007, 0167-2789

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 1.735

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/07:00024119

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

Delayed negative feedback; Stability and periodic solutions; Global attractor; Differentiation clock

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 14. 1. 2010 15:42, MUDr. Eva Pokojská

Anotace

V originále

Controlled timing of cell death in early development results in rhythmic segment formation during multicellular body prolongation. The process is regulated intracellularly, by transient oscillatory expression of nuclear transcription regulators, and can be modeled by a simple negative feedback loop. Role of transport/processing delay on stability, bifurcation direction, periodic solutions, and global attractor structure is analyzed for the unstable phase space region, bounded below by reaction nonlinearities and production/decay rates. Existence of two functionally different classes of dynamic transcription regulators is conjectured from the theoretical results.

Česky

Časová kontrola buněčné smrti během raného vývoje organismu má za následek formování segmentů v průběhu prodlužování těla mnohobuněčného organismu. Vnitrobuněčné řízení tohoto procesu je založeno na dočasně oscilující expresi jaderných transkripčních regulátorů, a lze jej modelovat pomocí jednoduché negativní zpětné vazby. Práce analyzuje (de)stabilizující roli zpoždění během transportu a zpracování, směr bifurkace, existující periodická řešení, jakož i strukturu globálniho atraktoru v nestabilním parametrovém prostoru, ohraničeném zezdola reakčními nelinearitami a rychlostí vzniku/rozpadu produktu. Z teoretických výsledků lze usuzovat na existenci dvou funkčně odlišných tříd dynamických transkripčních regulátorů.

Návaznosti

AV0Z60870520, záměr
Název: Prostorová a funkční dynamika biologických, ekologických a sociálně-ekonomických systémů v interakci s Globální změnou klimatu
MSM 141100002, záměr
Název: Molekulární patofyziologie multigenních chorob
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární patofyziologie multigenních chorob
MSM6007665808, záměr
Název: Fyzikální biologie -nové přístupy v biologickém výzkumu