J 2006

Automatic Detection of Histones on Chromosome X in Images of Cell Nuclei

ULMAN, Vladimír

Základní údaje

Originální název

Automatic Detection of Histones on Chromosome X in Images of Cell Nuclei

Název česky

Automatická detekce histonů u chromosomu X v obrazech buněčného jádra

Autoři

ULMAN, Vladimír (203 Česká republika, garant)

Vydání

Clinician and Technology (Lékař a technika), Praha, Czech Medical Association J.E.Purkyne, 2006, 0301-5491

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14330/06:00015770

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

image registration; voxel-based registration; top-hat filtering; image analysis

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 2. 6. 2010 16:27, RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D.

Anotace

V originále

The description of computer method used for detection of histone particle in the small vicinity of chromosome X. The input data were 3D images of histones with nuclei and chromosomes with nuclei. Acquired on confocal optical microscope. The method was evaluated on real data. Compared to human expert, it gave the same result on 91% of 139 test cases.

Česky

Popisuje počítačovou metodu použitou pro detekci histonových teček v blízkém okolí chromosomů X. Vstupní data byly 3D obrázky histonů s jádrem a chromosomů s jádrem. Pořízeno na konfokálním optickém mikroskopu. Metoda byla testována na reálných datech a dala v porovnání s lidským expertem stejný výsledek v 91% ze 139 testovaných případů.

Návaznosti

GP202/03/D033, projekt VaV
Název: Vliv metylace a acetylace na strukturu chromatinu
Investor: Grantová agentura ČR, Vliv metylace a acetylace na strukturu chromatinu
MSM0021622419, záměr
Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy