J 2006

Pseudomonas moraviensis sp. nov. and Pseudomonas vranovensis sp. nov., soil bacteria isolated on nitroaromatic compounds, and emended description of Pseudomonas asplenii

TVRZOVÁ, Ludmila, Peter SCHUMANN, Cathrin SPRÖER, Ivo SEDLÁČEK, Zdenka PÁČOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Pseudomonas moraviensis sp. nov. and Pseudomonas vranovensis sp. nov., soil bacteria isolated on nitroaromatic compounds, and emended description of Pseudomonas asplenii

Název česky

Pseudomonas moraviensis sp. nov. and Pseudomonas vranovensis sp. nov., půdní bakterie izolované na nitroaromatických látkách, a rozšířený popis Pseudomonas asplenii

Autoři

TVRZOVÁ, Ludmila (203 Česká republika, garant), Peter SCHUMANN (276 Německo), Cathrin SPRÖER (276 Německo), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika), Zdenka PÁČOVÁ (203 Česká republika), Ondrej ŠEDO (203 Česká republika), Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika), Maike STEFFEN (276 Německo) a Elke LANG (276 Německo)

Vydání

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, UK, Society for General Microbiology, 2006, 1466-5026

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 2.662

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00017345

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000242259900026

Klíčová slova anglicky

Pseudomonas moraviensis; Pseudomonas vranovensis; Pseudomonas asplenii; polyphasic taxonomy; nitroaromatic compounds

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 26. 6. 2009 10:28, prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.

Anotace

V originále

Two strains of Gram negative bacteria isolated from soil by selective enrichment with nitroaromatics were subjected to a polyphasic taxonomic study. On the basis of 16S rRNA gene sequence analysis both strains were found to belong to the genus Pseudomonas, within the Gammaproteobacteria. Strain 1B4T shared the highest sequence similarity with Pseudomonas koreensis DSM 16610T (99.5 %) and Pseudomonas jessenii CCM 4840T (99.3 %), strain 2B2T with Pseudomonas asplenii DSM 17133T (98.9 %), Pseudomonas fuscovaginae DSM 7231T (98.9 %) and Pseudomonas putida DSM 291T (98.7 %). On the basis of phylogenetic analysis, DNA-DNA hybridization and phenotype, including chemotaxonomic characteristics, two novel species, Pseudomonas moraviensis sp. nov. with the type strain CCM 7280T ( DSM 16007T, 1B4T ) and Pseudomonas vranovensis sp. nov. with the type strain CCM 7279T ( DSM 16006T, 2B2T), are proposed. The description of Pseudomonas asplenii was emended on the basis of supplementary data obtained in this study.

Česky

Podrobnému studiu s využitím metod polyfázické taxonomie byly podrobeny 2 kmeny půdních bakterií izolované selektivním nahromaděním na nitroaromatických látkách. Na základě sekvence genu pro 16S rRNA byly kmeny zařazeny do rodu Pseudomonas, mezi Gammaproteobacteria. Kmen 1B4T vykazoval nejvyšší příbuznost s kmenem Pseudomonas koreensis DSM 16610T (99.5 %) a Pseudomonas jessenii CCM 4840T (99.3 %), kmen 2B2T s Pseudomonas asplenii DSM 17133T (98.9 %), Pseudomonas fuscovaginae DSM 7231T (98.9 %) a Pseudomonas putida DSM 291T (98.7 %). Na ákladě fylogenetické analýzy, DNA-DNA hybridizace a fenotypu, včetně chemotaxonomických znaků, byly popsány dva nové druhy, Pseudomonas moraviensis sp. nov. s typovým kmenem CCM 7280T ( DSM 16007T, 1B4T ) a Pseudomonas vranovensis sp. nov. s typovým kmenem CCM 7279T ( DSM 16006T, 2B2T). Popis Pseudomonas asplenii byl rozšířen o data získaná v této studii.

Návaznosti

LC06034, projekt VaV
Název: Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase