Studium promotorů Treponema pallidum: charakterizace promotorů pro faktor sigma-54.

ČEJKOVÁ, Darina; Petra MATĚJKOVÁ a David ŠMAJS. Studium promotorů Treponema pallidum: charakterizace promotorů pro faktor sigma-54. In X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2006, s. 5. ISBN 80-210-3942-6.

Základní údaje

Originální název

Studium promotorů Treponema pallidum: charakterizace promotorů pro faktor sigma-54.

Název česky

Studium promotorů Treponema pallidum: charakterizace promotorů pro faktor sigma-54.

Název anglicky

Promoters of Treponema pallidum: promoters for sigma-54.

Autoři

ČEJKOVÁ, Darina; Petra MATĚJKOVÁ a David ŠMAJS

Vydání

Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. s. 5-5, 2006

Nakladatel

Masarykova univerzita v Brně

---

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

80-210-3942-6

Klíčová slova anglicky

T. pallidum ssp. pallidum; promoter; sigma-54

Štítky

promoter, sigma-54, T. pallidum ssp. pallidum

---

Anotace

V originále

Spirocheta T. pallidum ssp. pallidum, mikroaerofilní obligátní lidský patogen, způsobuje pohlavně přenosné onemocnění syfilis, které napadá různé tkáně a orgány. Různá stádia syfilis a schopnost infikovat různé orgány pravděpodobně vyžaduje regulaci genové exprese. Studovali jsme funkci faktoru sigma-54 (RpoN) a jeho pozitivního regulátoru FhlA. Funkcí sigma faktoru je vazba RNA–polymerázy k promotoru a zabránění nespecifické iniciace transkripce. Pro studium sigma-54 závislých promotorů byla použita analýza in silico, mapování promotorů pomocí PCR z cDNA (cDNA PCR) a transkripční fúze mezi predikovaným sigma-54 závislým promotorem a luxCDABE geny plazmidu pCS26, které slouží jako reportérový systém pro analýzu míry exprese. S využitím programu PromScan byly identifikovány sigma-54 závislé promotory v genomu T. p. pallidum Nichols.

Anglicky

The spirochete T. pallidum ssp. pallidum is the causative agent of syphilis, a sexually transmitted disease characterized by multiple stages and infection of different organs. It was hypothesized that T. pallidum regulates its gene expression during infection of humans. We have studied the function of sigma-54 factor (RpoN) and sigma-54-dependent promoters. Sigma factors inititate transcription by binding to promoter and to RNA-polymerase. The sigma-54-dependent promoters were identified by the PromScan software. pCS26 plasmid was used for the construction of the transcriptional fusions between the promoters and luxCDABE genes. This reporter system was used for verification of identified promoters. Six possible sigma-54-dependent promoters were identified in the genome of T. pallidum.

---

Návaznosti

GA310/04/0021, projekt VaV	Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměr	Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV	Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů