Treponema Genomics.

WEINSTOCK, George M.; David ŠMAJS; Petra MATĚJKOVÁ; Michal STROUHAL; Thomas J. ALBERT; Steven J. NORRIS; Timothy PALZKILL and Erica J. SODERGREN. Treponema Genomics. In Molecular Biology of Spirochetes. Praha: Státní zdravotní ústav., 2005, p. 96-100. Volume 373 NATO Science Series. ISBN 1-58603-665-3.

Basic information

Original name

Treponema Genomics.

Name in Czech

Genomika treponem.

Authors

WEINSTOCK, George M.; David ŠMAJS; Petra MATĚJKOVÁ; Michal STROUHAL; Thomas J. ALBERT; Steven J. NORRIS; Timothy PALZKILL and Erica J. SODERGREN

Edition

Praha, Molecular Biology of Spirochetes. p. 96-100, 5 pp. Volume 373 NATO Science Series, 2005

Publisher

Státní zdravotní ústav.

---

Other information

Language

English

Type of outcome

Chapter(s) of a specialized book

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

is not subject to a state or trade secret

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

1-58603-665-3

Keywords (in Czech)

DNA sekvence; komparativní genomika; syfilis; yaws; microarray čipy

Keywords in English

DNA sequence; comparative genomics; syphilis; yaws; microarray

Tags

comparative genomics, DNA sequence, microarray, syphilis, yaws

---

Abstract

In the original language

Treponemes include the agents of syphilis, yaws, and other diseases, but as a group are fastidious organisms that often can only be grown in animals. This has hampered molecular analysis, but much progress is geing made since genome sequences for these bacteria have been completed. The current state of the art involves comparative genomics, microarrays, whole genome clone sets, and other tools to unravel the biology of these pathogens. The chapter is a summary of results obtained by currently used methods to study these pathogens.

In Czech

Treponemata zahrnují etiologická agens syfilis, yaws a dalších onemocnění, jako skupina představují obligátní patogeny, které lze kultivovat pouze v živých zvířatech. Tento fakt zbrzdil výzkum patogeneze těchto onemocnění, nicméně pokroku bylo dosaženo od získání kompletní sekvence genomu kmene Nichols způsobujícího syfilis. Současné možnosti studia treponemat zahrnují metody komparativní genomiky jako microarray čipy, přípravu knihoven obsahující klony všech jednotlivých predikovaných genů. Tyto metody slouží k objasnění patogeneze jmenovaných onemocnění. Kapitola shrnuje dosažené výsledky komparativní a funkční genomiky patogenních treponemat.

---

Links

GA310/04/0021, research and development project	Name: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum Investor: Czech Science Foundation, Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete
NI7351, research and development project	Name: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice Investor: Ministry of Health of the CR