a 2006

Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ, Darina a David ŠMAJS

Základní údaje

Originální název

Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum.

Název anglicky

Identification and characterization of sigma-54-dependent promoters of Treponema pallidum.

Autoři

Vydání

Tomáškovy dny 2006. Sborník abstraktů. 2006

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/06:00016081

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

sigma-54-dependent promoters; Treponema pallidum.

Štítky

Změněno: 8. 4. 2010 15:31, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Spirocheta T. pallidum ssp. pallidum je původcem syfilis, pohlavního onemocnění charakterizovaného více stádii a postižením různých orgánů. Je tedy pravděpodobné, že T. pallidum mění expresi svých genů během infekce lidského hostitele. Studovali jsme funkci faktoru sigma-54 (RpoN) a jeho promotorů. Funkcí sigma faktorů je vazba RNA–polymerázy k promotoru a specifická iniciace transkripce. Pro studium promotorů závislých na faktoru sigma-54 byla použita analýza in silico pomocí programu PromScan a transkripční fúze mezi promotory a geny luxCDABE plazmidu pCS26. Za přítomnosti dalšího plazmidu nesoucího treponemální gen pro sigma-54 (rpoN) můžeme pomocí tohoto systému analyzovat funkci jednotlivých predikovaných promotorů. Výsledky potvrzují přítomnost sigma-54 závislých promotorů v genomu T. pallidum Nichols. Treponemální faktor sigma-54 je částečně zaměnitelný s escherichiálním faktorem sigma-54, a proto je vhodné experimenty provádět v kmenech rpoN-.

Anglicky

The spirochete T. pallidum ssp. pallidum is the causative agent of syphilis, a sexually transmitted disease characterized by multiple stages and infection of different organs. It was hypothesized that T. pallidum regulates its gene expression during infection of humans. We have studied the function of sigma-54 factor (RpoN) and sigma-54-dependent promoters. Sigma factors inititate transcription by binding to promoter and to RNA-polymerase. The sigma-54-dependent promoters were identified by the PromScan software. pCS26 plasmid was used for the construction of the transcriptional fusions between the promoters and luxCDABE genes. This reporter system was used for verification of identified promoters. The promoters of polA and tpF1 genes were shown to be dependent on overexpression of treponemal rpoN and fhlA both in wild type E. coli and, more extensively, in E. coli rpoN- or E. coli fhlA-. Regulation of polA and tpF1 genes was confirmed using Q-PCR technique.

Návaznosti

GA310/04/0021, projekt VaV
Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů