a 2006

Comparison ot the syphilis and yaws spirochete genomes: comparative genome sequencing of T. pallidum ssp. pallidum Samoa D.

MATĚJKOVÁ, Petra a David ŠMAJS

Základní údaje

Originální název

Comparison ot the syphilis and yaws spirochete genomes: comparative genome sequencing of T. pallidum ssp. pallidum Samoa D.

Název česky

Porovnání genomů původců syfilis a yaws: komparativní genomové sekvencování T. pallidum ssp. pallidum Samoa D

Autoři

Vydání

International Medical Postgraduate Conference. Abstract Book. 2006

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/06:00016083

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

comparative genome sequencing; T. pallidum ssp. pallidum Samoa D

Štítky

Změněno: 8. 4. 2010 15:25, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

Spirochetal genus Treponema includes several closely related pathogenic spirochetes. Treponema pallidum ssp. pallidum (TPA) is the causative agent of syphilis, T. pallidum ssp. pertenue (TPE) causes yaws. Although these two subspecies are microscopically and serologically indistinguishable, they cause different diseases. Little is known about genome differences between TPA and TPE genomes. The aim of this work was to employ dideoxyterminator sequencing for sequence differences discovery between Nichols (TPA) and Samoa D (TPE) genomes. All heterologous regions were successfully subjected to DDT sequencing and consensus sequences were obtained using three different approaches: 1) direct PCR product sequencing, 2) primer walking and 3) small insert library sequencing. Identified sequence differences will be used together with CGS data to compile the complete genome sequence of Samoa D strain.

Česky

V této práci jsme porovnali genomy původců syfilis - T. pallidum ssp. pallidum - a yaws - T. pallidum ssp. pallidum Samoa D pomocí techniky komparativního genomového sekvencování. V práci jsou diskutovány nalezené rozdíly mezi oběma genomy.

Návaznosti

GA310/04/0021, projekt VaV
Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů