Estimating Large Local Motion in Live-Cell Imaging Using Variational Optical Flow

HUBENÝ, Jan; Vladimír ULMAN a Pavel MATULA. Estimating Large Local Motion in Live-Cell Imaging Using Variational Optical Flow. In VISAPP 2007 Second International Conference On Computer Vision Theory And Applications, Proceedings. Portugal: INSTICC PRESS, 2007, s. 542-548. ISBN 978-972-8865-74-0.

Základní údaje

Originální název

Estimating Large Local Motion in Live-Cell Imaging Using Variational Optical Flow

Název česky

Odhadování velkých lokálních pohybů v in-vivo obrazových sekvencích pomocí variačních metod optického toku

Autoři

HUBENÝ, Jan; Vladimír ULMAN ORCID a Pavel MATULA ORCID

Vydání

Portugal, VISAPP 2007 Second International Conference On Computer Vision Theory And Applications, Proceedings, od s. 542-548, 7 s. 2007

Nakladatel

INSTICC PRESS

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering

Stát vydavatele

Španělsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14330/07:00020059

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

978-972-8865-74-0

UT WoS

000250107900082

Klíčová slova anglicky

live-cell imaging motion tracking 3D imaging variational optical flow

Štítky

CBIA, cbia-web

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

The paper studies the application of state-of-the-art variational optical flow methods for motion tracking of fluorescently labeled targets in living cells. Four variants of variational optical flow methods suitable for this task are briefly described and evaluated in terms of the average angular error. Artificial ground-truth image sequences were generated for the purpose of this evaluation. The aim was to compare the ability of those methods to estimate local divergent motion and their suitability for data with combined global and local motion. Parametric studies were performed in order to find the most suitable parameter adjustment. It is shown that a selected optimally tuned method tested on real 3D input data produced satisfactory results. Finally, it is shown that by using appropriate numerical solution, reasonable computational times can be achieved even for 3D image sequences.

Česky

Článek studuje aplikaci stávajících metod na výpočet optického toku na odhad lokálních pohybů v in-vivo obrazových sekvencích. Nejprve jsou popsány čtyři metody na výpočet optického toku, které jsou vhodné pro tento úkol. Tyto metody jsou následně vyhodnoceny pomocí parametrických studií na umělých datech. Vybraná nejlepší metoda s nejlepším nastavení parametrů je následně vyzkoušena na reálné 3D obrazové sekvenci. Je ukázáno, že i pro tuto sekvenci produkuje náš přistup přijatelné výsledky. Nakonec je diskutována doba běhu a nároky na pamět, které jsou akceptovatelné.

---

Návaznosti

GD102/05/H050, projekt VaV	Název: Integrovaný přístup k výchově studentů DSP v oblasti paralelních a distribuovaných systémů Investor: Grantová agentura ČR, Integrovaný přístup k výchově studentů DSP v oblasti paralelních a distribuovaných systémů
LC535, projekt VaV	Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622419, záměr	Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy