D 2006

Influence of magnetic particles on the reproducibility of RAPD and rep-PCR fingerprinting of lactic acid bacteria

RITTICH, Bohuslav, Jana KŘÍŽOVÁ, Alena ŠPANOVÁ, Petra NĚMCOVÁ, Daniel HORÁK et. al.

Základní údaje

Originální název

Influence of magnetic particles on the reproducibility of RAPD and rep-PCR fingerprinting of lactic acid bacteria

Název česky

Vliv magnetických částic na reprodukovatelnost RAPD a rep-PCR fingrprintů

Autoři

RITTICH, Bohuslav (203 Česká republika, garant), Jana KŘÍŽOVÁ (203 Česká republika), Alena ŠPANOVÁ (203 Česká republika), Petra NĚMCOVÁ (203 Česká republika) a Daniel HORÁK (203 Česká republika)

Vydání

York, Velká Británie, Ninth International Symposium on hyphenated techniques in chromatography and hyphenated chromatographic analyzers, HTC-9, od s. P167, 1 s. 2006

Nakladatel

Royal Society of Chemistry

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00024563

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

Magnetic particles; HEMA-co-GMA; Bifidobacterium; RAPD; rep-PCR; reproducibility

Štítky

Změněno: 22. 1. 2009 18:56, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Anotace

ORIG CZ

V originále

DNA was isolated from Bifidobacterium cells using phenol extraction metod, salting out using 6 M NaCl, and adsorption on magnetic poly(2-hydroxyethyl methacrylate-co-glycidyl methacrylate) (HEMA-co-GMA) particles containing carboxyl groups. It was shown that DNA eluted from magnetic particles into TE buffer can be succesfully used in molecular fingerprinting procedures. The reproducibility of tested methods were comparable with phenol extraction method.

Česky

DNA byla izolována z buněk bifidobakterií pomocí fenolové extrakce, vysolováním 6 M NaCl a adsorpcí na magnetické poly(2-hydroxyethyl methakrylát-co-glycidyl methakrylát) (HEMA-co-GMA) částice pokryté karboxylovými skupinami. Bylo zjištěno, že DNA eluovaná z magnetických částic za použití TE pufru může být použita při tvorbě fingrprintů. Reprodukovatelnost testovaných metod byla srovnatelná s fenolovou extrakcí.

Návaznosti

GA203/05/2256, projekt VaV
Název: Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
Investor: Grantová agentura ČR, Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
1G46045, projekt VaV
Název: Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů baktérií mléčného kvašení.
Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů bakterií mléčného kvašení