Taxonomic analysis and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761

ŠPANOVÁ, Alena, Jana KŘÍŽOVÁ, Radka BURDYCHOVÁ, Vladimír DRÁB a Bohuslav RITTICH. Taxonomic analysis and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761. In 10th International symposium on the genetics of industrial microorganisms. Praha: Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha, 2006, s. P046, 1 s. ISBN 80-239-7323-1.

Základní údaje

• Originální název: Taxonomic analysis and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761
• Název česky: taxonomická analýza a reklasifikace Bifidobacterium adolescentis CCM 3761
• Autoři: ŠPANOVÁ, Alena (203 Česká republika, garant), Jana KŘÍŽOVÁ (203 Česká republika), Radka BURDYCHOVÁ (203 Česká republika), Vladimír DRÁB (203 Česká republika) a Bohuslav RITTICH (203 Česká republika).
• Vydání: Praha, 10th International symposium on the genetics of industrial microorganisms, od s. P046, 1 s. 2006.
• Nakladatel: Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/06:00031777
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• ISBN: 80-239-7323-1
• Klíčová slova anglicky: Bifidobacterium; ARDRA; RAPD; rep-PCR; sequencing; species identification
• Štítky: ARDRA, Bifidobacterium, RAPD, rep-PCR, Sequencing, species identification
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

DNA fingerprinting methods (ARDRA, RAPD, rep-PCR) have been applied for discrimination of Bifidobacterium species. Sixteen Bifidobacterium strains of eleven species which were used to evaluate the discrimination power of the above-mentioned methods were obtained from the Czech Collection of Microorganisms (CCM, Brno, Czech Republic), the American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, USA), and the Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ, Braunschweig, Germany). In characterisation of the studied strains it was found that the results obtained for the strain B. adolescentis CCM 3761 did not correspond with its taxonomic position and the strain should be reclassified as B. pseudocatenulatum. The amplicons of the 16S rDNA region of B. adolescentis CCM 3761 and B. catenulatum CCM 7094, B. pseudocatenulatum DSM 16992T, and B. adolescentis CCM 4987T were used for sequencing of DNA and for confirmation of species identification.

Anotace česky

Typizační metody (ARDRA, RAPD, rep-PCR) byly použity pro rozlišení bifidobakterií. K ověření rozlišovací schopnosti výše uvedených metod byly použity sbírkové kmeny (CCM, ATCC, DSZM). Bylo zjištěno, že kmen Bifidobacterium adolescentis CCM 3761 neodpovídá jeho taxonomické pozici a kmen byl reklasifikován jako B. pseudocatenulatum. Amplikony z úseku 16S rDNA kmenů B. adolescentis CCM 3761,B. catenulatum CCM 7094, B. pseudocatenulatum DSM 16992T a B. adolescentis CCM 4987T byly použity k sekvencování DNA a potvrzení druhové identifikace.

Návaznosti

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

• QF3169, projekt VaV: Název: Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů baktérií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin

Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů bakterií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin