D 2006

Taxonomic analysis and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761

ŠPANOVÁ, Alena, Jana KŘÍŽOVÁ, Radka BURDYCHOVÁ, Vladimír DRÁB, Bohuslav RITTICH et. al.

Základní údaje

Originální název

Taxonomic analysis and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761

Název česky

taxonomická analýza a reklasifikace Bifidobacterium adolescentis CCM 3761

Autoři

ŠPANOVÁ, Alena (203 Česká republika, garant), Jana KŘÍŽOVÁ (203 Česká republika), Radka BURDYCHOVÁ (203 Česká republika), Vladimír DRÁB (203 Česká republika) a Bohuslav RITTICH (203 Česká republika)

Vydání

Praha, 10th International symposium on the genetics of industrial microorganisms, od s. P046, 1 s. 2006

Nakladatel

Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00031777

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

80-239-7323-1

Klíčová slova anglicky

Bifidobacterium; ARDRA; RAPD; rep-PCR; sequencing; species identification

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 2. 1. 2007 14:50, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Anotace

ORIG CZ

V originále

DNA fingerprinting methods (ARDRA, RAPD, rep-PCR) have been applied for discrimination of Bifidobacterium species. Sixteen Bifidobacterium strains of eleven species which were used to evaluate the discrimination power of the above-mentioned methods were obtained from the Czech Collection of Microorganisms (CCM, Brno, Czech Republic), the American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, USA), and the Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ, Braunschweig, Germany). In characterisation of the studied strains it was found that the results obtained for the strain B. adolescentis CCM 3761 did not correspond with its taxonomic position and the strain should be reclassified as B. pseudocatenulatum. The amplicons of the 16S rDNA region of B. adolescentis CCM 3761 and B. catenulatum CCM 7094, B. pseudocatenulatum DSM 16992T, and B. adolescentis CCM 4987T were used for sequencing of DNA and for confirmation of species identification.

Česky

Typizační metody (ARDRA, RAPD, rep-PCR) byly použity pro rozlišení bifidobakterií. K ověření rozlišovací schopnosti výše uvedených metod byly použity sbírkové kmeny (CCM, ATCC, DSZM). Bylo zjištěno, že kmen Bifidobacterium adolescentis CCM 3761 neodpovídá jeho taxonomické pozici a kmen byl reklasifikován jako B. pseudocatenulatum. Amplikony z úseku 16S rDNA kmenů B. adolescentis CCM 3761,B. catenulatum CCM 7094, B. pseudocatenulatum DSM 16992T a B. adolescentis CCM 4987T byly použity k sekvencování DNA a potvrzení druhové identifikace.

Návaznosti

MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
QF3169, projekt VaV
Název: Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů baktérií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin
Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů bakterií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin