2006
Identification of mycobacterium sp. cells using PCR after isolation of PCR-ready DNA by magnetic microspheres
TĚŠÍNSKÁ, Iva, Alena ŠPANOVÁ, Bohuslav RITTICH a Milan BARTOŠZákladní údaje
Originální název
Identification of mycobacterium sp. cells using PCR after isolation of PCR-ready DNA by magnetic microspheres
Název česky
Identifikace buněk Mycobacterium sp. pomocí PCR po izolaci DNA pomocí magnetických mikročástic
Autoři
TĚŠÍNSKÁ, Iva (203 Česká republika), Alena ŠPANOVÁ (203 Česká republika), Bohuslav RITTICH (203 Česká republika, garant) a Milan BARTOŠ (203 Česká republika)
Vydání
Innsbruck, 26th International symposium on Separation of Proteins, Peptides and Polynucleotides, od s. 77-77, 1 s. 2006
Nakladatel
Dechema
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Rakousko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/06:00016212
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
Mycobacterium; Identification; PCR; P(HEMA-co-GMA) magnetic particles;
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 5. 1. 2007 18:42, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
V originále
The aim of this work was to optimize the conditions for DNA and RNA adsorption and desorption depending on the composition of the binding buffer. For this study, chicken erythrocyte DNA and calf liver RNA were used as model compounds. The final binding buffer composition was optimized using the following combinations: 4, 6, 8, and 12% PEG, and 1.0, 1.5, 2.0, and 2.5M NaCl. The binding buffer containing 8% PEG and 2M NaCl (final concentration) was shown to be the most appropriate combination for further studies. Separated DNA was eluted using TE buffer. The method developed was applied for isolation of PCR-ready DNA from mycobacterial cells using magnetic particles. Mycobacterial DNA from the eluate was detected by amplification of the IS900 and IS901 elements, special markers for the species Mycobacterium sp. avium and Mycobacterium sp. paratuberculosis. .
Česky
Cílem této práce bylo optimalizovat pro adsorpci a desorpci v závislosti na složení vazebného pufru.DNA z kuřecích erytrocytů a RNA z hovězích jater byly použity jako modelové sloučeniny. Optimalizace vazebného pufru byla provedena z následujících kombinací: 4, 6, 8, a 12% PEG; a 1,0, 1,5, 2,0, and 2,5 M NaCl. Vazebný pufr obsahující 8 % PEG a 2 M NaCl byl shledán jako nejvhodnější kombinace pro další studue. Separovaná DNAbyla eluována pomocí TE pufru. Vyvinutý postup byl využit pro izolaci DNA v kvalitě pro PCR z buněk mykobakterií za použitímagnetických částic. DNA v eluátu byla detekována amplifikací IS900 a IS901 elementů, speciciálních markerů pro druhy Mycobacterium sp. avium a Mycobacterium sp. paratuberculosis.
Návaznosti
| GA203/05/2256, projekt VaV |
|