D 2006

A comparative study of false discovery rate procedures in R

SCHIMEK, Michael a Tomáš PAVLÍK

Základní údaje

Originální název

A comparative study of false discovery rate procedures in R

Název česky

Srovnávací studie FDR procedur v jazyce R

Autoři

SCHIMEK, Michael a Tomáš PAVLÍK

Vydání

21. vyd. Galway, Ireland, Proceedings of the 21th International Workshop on Statistical Modelling. Galway, Ireland, 3-7 July 2006, od s. 466-473, 8 s. 2006

Nakladatel

Statistical Modelling Society

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10103 Statistics and probability

Stát vydavatele

Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

1-86220-180-3

Klíčová slova anglicky

Correlation; Error control; False Discovery Rate; Microarray

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 1. 4. 2010 09:20, RNDr. Tomáš Pavlík, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

Statistical procedures for the identification of differentially expressed genes in microarray studies involve a serious multiple comparison problem as we have to carry out as many hypothesis testings as the number of candidate genes in the experiment. This paper is concerned with the recent type I error control concept of the false discovery rate (FDR), for which an increasing number of competing estimates is available in R. However, there is little comparative evidence. Based on the most popular modified t-statistic independent as well as co-regulated gene expression measurements are compared in a simulation study. Finally conclusions are drawn for practical microarray analysis.

Česky

Tento příspěvek různé metody pro kontrolu chyby I. druhu při identifikaci různě exprimovaných genů v analýze dat DNA mikročipů.