a 2006

ERIC-PCR fingerprinting of presumptive Aeromonas caviae strains isolated from surface waters

ŠVEC, Pavel, Dana NOVÁKOVÁ a Ivo SEDLÁČEK

Základní údaje

Originální název

ERIC-PCR fingerprinting of presumptive Aeromonas caviae strains isolated from surface waters

Název česky

ERIC-PCR typizace presupmtivních kmenů Aeromonas caviae izolovaných z povrchových vod

Autoři

ŠVEC, Pavel (203 Česká republika, garant), Dana NOVÁKOVÁ (203 Česká republika) a Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika)

Vydání

2st FEMS Congress of European Microbiologists, 2006

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Španělsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00021835

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

ERIC-PCR; Aeromonas caviae; identification; taxonomy; water

Štítky

Změněno: 24. 3. 2010 13:38, doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

A group of 76 bacterial strains identified phenotypically as presumptive Aeromonas caviae was characterized by ERIC-PCR fingerprinting and compared to reference strains representing all described Aeromonas species. Biochemical traits revealed by environmental aeromonads were highly heterogeneous, however they matched the phenotypic criteria stated in the species description of A. caviae. All strains were typeable by ERIC primer and generated DNA fragments ranging from 200 to 3500 bp. Cluster analysis of ERIC-PCR fingerprints separated analysed strains into five clusters and grouped some of them with particular reference strains: A. caviae cluster (8 strains), A. hydrophila ssp. hydrophila / A. simiae cluster (11), A. media (13). Remaining two clusters (39 and 5 strains) were separated from all reference strains. All strains including selected representative strains grouped in individual clusters revealed typical visually very close basic fingerprint patterns implying that the biochemical identification of the particular strains as A. caviae is doubtful. Obtained results imply ERIC-PCR as a promising method applicable for fast, reliable and cheap screening of aeromonads isolated from the environment. Financial support from project MSM0021622416 is gratefully acknowledged.

Česky

Práce popisuje využití metody ERIC-PCR pro identifikaci presumptivních kmenů Aeromonas cavie izolovaných z povrchových vod.

Návaznosti

MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase