2005
Funkční analýza separovaných alel v kvasinkách: spolehlivá metoda k určení statutu nádorového supresoru p53
ŠMARDOVÁ, Jana, Miluše SVITÁKOVÁ, Barbora RAVČUKOVÁ, Diana GROCHOVÁ, Jana VAŇKOVÁ et. al.Základní údaje
Originální název
Funkční analýza separovaných alel v kvasinkách: spolehlivá metoda k určení statutu nádorového supresoru p53
Název česky
Funkční analýza separovaných alel v kvasinkách: spolehlivá metoda k určení statutu nádorového supresoru p53
Název anglicky
Functional analysis of separated alleles in yeast: a reliable method for assesment of the p53 status
Autoři
ŠMARDOVÁ, Jana (203 Česká republika, garant), Miluše SVITÁKOVÁ (203 Česká republika), Barbora RAVČUKOVÁ (203 Česká republika), Diana GROCHOVÁ (203 Česká republika), Jana VAŇKOVÁ (203 Česká republika) a Iva KROUPOVÁ (203 Česká republika)
Vydání
Olomouc, Dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie, od s. 18-18, 1 s. 2005
Nakladatel
MEDUCA
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
30200 3.2 Clinical medicine
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/05:00021853
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
FASAY; p53; p53 transactivation; gap repair
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 15. 1. 2007 08:59, prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
V originále
FASAY je semikvantitativní metoda pro detekci mutací p53 v klinickém materiálu, obvykle v nádorových tkáních a periferní krvi. Protein p53 je odvozen z mRNA izolované z testovaného materiálu pomocí RT-PCR a jeho transaktivační schopnost je vyhodnocena v kvasinkových buňkách prostřednictvím ADE2 reportéru. Transaktivace proteinem p53 je stanovena podle barvy kvasninkových kolonií na agarových plotnách s nízkým obsahem adeninu. Kvasinkové buňky tvoří velké bílé kolonie pokud byl reportérský gen aktivován funkčním proteinem p53 nebo malé červené kolonie, pokud reportér nebyl aktivován. FASAY ná tyto výhody: (1) analyzuje obě alely p53 odděleně, (2) její vysoká citlivost umožňuje detekci mutací p53 i pokud v případě, že mutovaných buněk je v buněné populaci pouhých 10%, (3) umožňuje rozlišení plně a částečně inaktivujících mutací, (4) analyzuje podstatnou část genu p53, (5) umožňuje snadnou přípravu templátů pro sekvenování p53.
Anglicky
FASAY is a sensitive semi-quantitative method of detection of p53 mutations in clinical material, such as tumor tissues, peripheral blood cells, etc. The p53 is derived from mRNA of analyzed material by RT-PCR and its transactivation ability is tested in yeast cells by using of ADE2 reporter gene. Transactivation by p53 is assessed simply according to the color of yeast colonies growing on agar plates with lovele of adenine. Yeast cells form either large white colonies if the reporter was activated by functional p53 or small red colonies if the reporter was not activated. FASAY possesses several advantages: (1) it analyzes both alleles of the p53 gene separately, (2) its high sensitivity allows detection of about 10% of p53 mutation harboring cells among mostely negative cells, (3) it can distinguish fully inactivating p53 mutations from partially inactivating ones, (4) it analyzes substantial part of the p53 gene, (5) it allows preparation of template useful for sequencing of the p53 gene.
Návaznosti
| MSM0021622415, záměr |
|