a 2006

Characterization of staphylococcal type strains by whole-cell protein analysis and (GTG)5-PCR fingerprinting.

NOVÁKOVÁ, Dana, Pavel ŠVEC a Ivo SEDLÁČEK

Základní údaje

Originální název

Characterization of staphylococcal type strains by whole-cell protein analysis and (GTG)5-PCR fingerprinting.

Název česky

Charakterizace typových kultur stafylokoků analýzou celkových buněčných proteinů a (GTG)5-PCR analýzou.

Autoři

NOVÁKOVÁ, Dana (203 Česká republika, garant), Pavel ŠVEC (203 Česká republika) a Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika)

Vydání

2nd FEMS Congress of European Microbiologists, 2006

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00021871

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

staphylococcal type strains; whole-cell protein analysis; (GTG)5-PCR fingerprinting

Štítky

Změněno: 24. 3. 2010 13:39, doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

A group of 47 type strains representing all validly described staphylococcal species and subspecies was characterized by whole-cell protein analysis by using sodium dodecylsulfate-polyacrylamide gel electrophoresis and rep-PCR fingerprinting with the (GTG)5 primer. All strains were well typeable and revealed unique fingerprints by both methods. The individual staphylococcal type strains were differentiated on the level of 74 % using the protein analysis, with exception of novobiocin-resistant species, and on the level of 68 % by using the (GTG)5-PCR fingerprinting. Generally, all subspecies of the individual species showed close protein profiles that were grouped into individual clusters. Similarly, but with a few exceptions, the individual subspecies were separated into the distinct clusters using the (GTG)5-PCR fingerprinting. No clear correlation between the clustering obtained by both methods and the phylogenetic relationships of the analysed species was observed. However, most of the phylogenetically closely related coagulase-negative novobiocin-resistant species revealed very similar protein patterns. Our results showed the whole-cell protein profile analysis as well as rep-PCR fingerprinting with the (GTG)5 primer as suitable typing tools for characterization of staphylococci and their combination could be a helpful approach for identification of staphylococci. Financial support from project FRVS 2658 is gratefully acknowledged.

Česky

Analýza celkových buněčných proteinů a (GTG)5-PCR profilů provedena u všech validně popsaných druhů a poddruhů stafylokoků.

Návaznosti

MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase