2007
The optimization of sample treatment for spectral karyotyping with applications for human tumour cells
LOJA, Tomáš; Petr KUGLÍK; Alexandra OLTOVÁ; Petra ŠMUHAŘOVÁ; Karel ZITTERBART et al.Základní údaje
Originální název
The optimization of sample treatment for spectral karyotyping with applications for human tumour cells
Název česky
Optimalizace zpracování preparátů pro spektrální karyotypování s využitím pro lidské nádorové buňky
Autoři
LOJA, Tomáš; Petr KUGLÍK; Alexandra OLTOVÁ; Petra ŠMUHAŘOVÁ; Karel ZITTERBART; Viera BAJČIOVÁ a Renata VESELSKÁ
Vydání
Cytogenetic and Genome Research, Basel, S. Karger AG, 2007, 1424-8581
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 2.402
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/07:00019034
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
Klíčová slova anglicky
spectral karyotyping; molecular cytogenetics; aging procedure; protease pretreatment; human tumour cells; neuroblastoma; Wilms' tumour
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 18. 6. 2009 12:52, prof. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc.
V originále
Spectral karyotyping (SKY) represents an important tool for the investigation of the complex chromosomal rearrangements (CCRs) in many human malignancies which may be difficult to characterize by conventional banding techniques. The main goal of our work was to optimize the most important steps in the preparation of molecular cytogenetic slides for a SKY protocol. This approach consisted of optimization of both the aging procedure and protease pretreatment of the slides, with special regard given to the preservation of chromosome structure and shape, as well as to the intensity of hybridization signals. The best results were obtained with a chemical aging procedure using SSC or ethanol in combination with trypsin pretreatment applied at a higher concentration for a shorter period of pretreatment. A resulting protocol for SKY also applicable to human solid tumour cells was subsequently proposed. The practical potential of the SKY technique was demonstrated on examples of two types of human embryonal tumours - neuroblastoma and Wilms tumour, in which some kinds of chromosomal aberrations were not detectable by means of classic cytogenetic methods.
Česky
Spektrální karyotypování (SKY) představuje důležitý metodický přístup v oblasti výzkumu komplexních chromosomálních přestaveb (CCRs) u mnoha typů lidských malignit, u nichž může být obtížná charakterizace pomocí konvenčních pruhovacích technik. Hlavním cílem naší práce byla optimalizace nejdůležitějších kroků při přípravě preparátů pro techniku SKY - tedy procedury zestaršení preparátů a předpůsobení pomocí proteáz - s ohledem na uchování struktury a tvaru chromosomů a na intenzitu hybridizačních signálů. Nejlepší výsledky byly dosaženy pomocí chemického zestaršení s využitím SSC nebo ethalonu v kombinaci s s krátkým předpůsobením trypsinem o vysoké koncentraci. Následně byl navržen výsledný optimalizovaný protokol pro SKY, který je využitelný i pro buňky lidských solidních nádorů. Praktický potenciál optimalizovaného protokolu pro SKY byl demonstrován na příkladu dvou druhů lidských embryonálních nádorů - neuroblastomu a Wilmsova tumoru, u nichž některé typy chromosomálních aberací nebyly detekovatelné pomocí klasických cytogenetických metod.
Návaznosti
| MSM0021622415, záměr |
| ||
| NR9125, projekt VaV |
|