Isolation and characterization of microsatellites in Leuciscus cephalus (Cypriniformes, Cyprinidae) and cross-species amplification within the family Cyprinidae.

VYSKOČILOVÁ, Martina, Andrea ŠIMKOVÁ a Jean-François MARTIN. Isolation and characterization of microsatellites in Leuciscus cephalus (Cypriniformes, Cyprinidae) and cross-species amplification within the family Cyprinidae. Molecular Ecology Notes. Blackwell Publishing, 2007, roč. 7, č. 6, s. 1150-1154. ISSN 1471-8278.

Základní údaje

• Originální název: Isolation and characterization of microsatellites in Leuciscus cephalus (Cypriniformes, Cyprinidae) and cross-species amplification within the family Cyprinidae.
• Název česky: Izolace a charakterizace nových mikrosatelitů u Leuciscus cephalus (Cypriniformes, Cyprinidae) a cross-species amplifikace v čeledi Cyprinidae.
• Autoři: VYSKOČILOVÁ, Martina (203 Česká republika, garant, domácí), Andrea ŠIMKOVÁ (703 Slovensko, domácí) a Jean-François MARTIN (250 Francie).
• Vydání: Molecular Ecology Notes, Blackwell Publishing, 2007, 1471-8278.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Impakt faktor: Impact factor: 1.257
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/07:00020260
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• UT WoS: 000250647700065
• Klíčová slova anglicky: Leuciscus; Cyprinidae; microsatellites; primers; cross-amplification
• Štítky: cross-amplification, Cyprinidae, Leuciscus, microsatellites, primers

Anotace

Thirteen polymorphic microsatellites were isolated from Leuciscus cephalus, a widespread cyprinid species with great ecological tolerance. Together with the cross-species amplification of six additional loci originally published for three cyprinid fish species, we optimized a multiplex panel for L. cephalus allowing the genotyping of 19 polymorphic loci. Number of alleles and heterozygosity per locus in a sample of 20 fish individuals ranged from two to sixteen and from 0.05 to 0.90, respectively. These primers will be useful in determining the population structure of L. cephalus. In addition, successful cross-amplification was obtained for several species of Cyprinidae.

Anotace česky

Pro Leuciscus cephalus bylo izolováno a charakterizováno 13 polymorfních mikrosatelitů, úspěšně bylo testováno 6 mikrosatelitových markerů původně popsaných pro jiné druhy z čeledi Cyprinidae. Dále bylo všech 19 mikrosatelitů použito pro cross-species amplifikaci u několika daších druhů ryb z čeledi Cyprinidae.

Návaznosti

• GA524/04/1128, projekt VaV: Název: MHC třída IIB genů evropských kaprovitých ryb: jejich genetická variabilita a evoluce ve vztahu k životní strategii hostitelů a parazitismu

Investor: Grantová agentura ČR, MHC třída IIB genů evropských kaprovitých ryb: jejich genetická variabilita a evoluce ve vztahu k životní strategii hostitelů a parazitismu

• LC522, projekt VaV: Název: ICHTYOPARAZITOLOGIE - centrum základního výzkumu

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Ichtyoparazitologie - centrum základního výzkumu

• MSM0021622416, záměr: Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase