Towards Reliable Autofocusing in Automated Microscopy

BRÁZDILOVÁ, Silvie Luisa. Towards Reliable Autofocusing in Automated Microscopy. In Proceedings of the 4th International Conference on Informatics in Control, Automation and Robotics. Portugal: Insticc Press, 2007, s. 440-448, 8 s. ISBN 978-972-8865-82-5.

Základní údaje

Originální název

Towards Reliable Autofocusing in Automated Microscopy

Název česky

Spolehlivé zaostřování v automatizované mikroskopii

Autoři

BRÁZDILOVÁ, Silvie Luisa (203 Česká republika, garant)

Vydání

Portugal, Proceedings of the 4th International Conference on Informatics in Control, Automation and Robotics, od s. 440-448, 8 s. 2007

Nakladatel

Insticc Press

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Francie

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14330/07:00022191

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

978-972-8865-82-5

UT WoS

000252639500066

Klíčová slova anglicky

Fluorescence microscopy; focus function; genetic programming

Štítky

fluorescence microscopy, focus function, genetic programming

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

The results presented in this paper are twofold. First, autofocusing in automated microscopy is studied and evaluated with respect to biomedical samples whose images can have more than one in-focus planes. While the proposed procedure for finding the maximum of a focus function in a short time works satisfactorily, the focus function itself is identified as the weakest link of the whole process. Second, an interesting property of functions used for genetic programming, and an algorithm for generating new individuals are introduced. Their usefulness and applicability are demonstrated on the problem of finding a new focus function for automated autofocusing in microscopy.

Česky

Tento článek prezentuje dvojí výsledek. Prvně je provedena studie a vyhodnocení automatického zaostřování v automatické mikroskopii s ohledem na biomedicínské vzorky, jejichž ostřicí funkce může mít více než jednu rovinu ostrosti. Zatímco nově navržený algoritmus pro nalezení maxima ostřicí funkce v krátkém čase dává uspokojivé výsledky, samotná ostřicí funkce je identifikována jakožto nejslabší článek celého procesu. Dále je prezentována zajímavá vlastnost funkcí použitých pro genetické programování spolu s algoritmem pro generování nových jedinců. Jejich užitečnost a použitelnost jsou předvedeny na problému nalezhení nové ostřicí funkce pro automatické zaostřování v mikroskopii.

---

Návaznosti

LC535, projekt VaV	Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622419, záměr	Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
2B06052, projekt VaV	Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů