STROUHAL, Michal, Petra MATĚJKOVÁ, David ŠMAJS, E. SODERGREN, S. J. NORRIS a G. M. WEINSTOCK. Comparative genomics of closely related treponemal strains. In In Abstract Book: 17th European Congress of Clinical Microbiology and Infectous Diseases, INTERNATIONAL JOURNAL OF ANTIMICROBIAL AGENTS. Munich, Germany: European Congress of Clinical Microbiology and Infectous Diseases, 2007, s. 915. ISSN 0924-8579.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Comparative genomics of closely related treponemal strains
Název česky Komparativní genomika příbuzných treponemálních kmenů
Autoři STROUHAL, Michal, Petra MATĚJKOVÁ, David ŠMAJS, E. SODERGREN, S. J. NORRIS a G. M. WEINSTOCK.
Vydání Munich, Germany, In Abstract Book: 17th European Congress of Clinical Microbiology and Infectous Diseases, INTERNATIONAL JOURNAL OF ANTIMICROBIAL AGENTS, s. 915-915, 2007.
Nakladatel European Congress of Clinical Microbiology and Infectous Diseases
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 2.338
Organizační jednotka Lékařská fakulta
ISSN 0924-8579
UT WoS 000253692400751
Klíčová slova anglicky Comparative genomics; treponemal strains
Štítky comparative genomics, treponemal strains
Změnil Změnil: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Změněno: 8. 4. 2010 14:46.
Anotace
Genus Treponema includes several pathogenic spirochetes: Treponema pallidum ssp. pallidum (TPA) is the causative agent of sexually transmitted syphilis, Treponema pallidum ssp. pertenue (TPE) causes endemic nonveneral treponemal infections and T. paraluiscuniculi (TPAR) is the etiologic agent of veneral syphilis in rabbits and does not infect humans. These treponemes cannot be continuously cultivated under in vitro conditions and are indistinguishable by morphological and serological methods. In this study, genomes of closely related treponemes were compared. When compared to the Nichols genome the prominent indels and sequence changes were preferentially localised in tpr genes (and in the hypothetical genes in the vicinity of tpr genes). Differences in number of tandem repetitions within the gene TP470 and genes TP0433-4 (hypothetical genes) were detected in all analysed strains. In the second case fusion of both genes (TP0433-4) resulted in one acidic repeat protein gene (arp gene).
Anotace česky
Metoda whole genome fingerprinting (WGF) byla použita pro srovnání genomů kmenů Treponema pallidum ssp. pallidum Nichols, SS14 (TPA), Treponema pallidum ssp. pertenue Samoa D (TPE) a Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A (TPAR).
Návaznosti
GA310/07/0321, projekt VaVNázev: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaVNázev: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
VytisknoutZobrazeno: 26. 4. 2024 04:50