a 2007

PCR diagnostika a molekulární typizace původce syfilis: aktuální problémy PCR detekce.

ŠMAJS, David

Základní údaje

Originální název

PCR diagnostika a molekulární typizace původce syfilis: aktuální problémy PCR detekce.

Název anglicky

PCR diagnostics of syphilis: problems and solutions.

Autoři

ŠMAJS, David (203 Česká republika, garant)

Vydání

Rutinní analýza nukleových kyselin molekulárně-biologickými technikami. 2007

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14110/07:00019070

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

PCR diagnostics; syphilis
Změněno: 8. 4. 2010 14:59, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

V originále

Komparativní genomika patogenních spirochet odhalila chromosomální oblasti původce syfilis, Treponema pallidum ssp. pallidum, které jsou variabilní v několika vyšetřených kmenech tohoto poddruhu a které jsou ohraničeny konzervovanými sekvencemi. Zavedli jsme metodu detekce chromosomální DNA T. p. pallidum dvoukrokovou (nested) PCR reakcí, která amplifikuje část genu TP0319 (tmpC), kódujícího hypotetický membránový lipoprotein. PCR amplifikace a sekvenování DNA genů TP0136 a TP0548 z pozitivních vzorků prokázalo výskyt jak kmenů sekvenčně identických s kmenem T. p. pallidum SS14, tak také unikátních syfilitických kmenů, doposud u T. p. pallidum nepopsaných. Aktuální problémy PCR detekce T. p. pallidum v klinickém materiálu zahrnující zejména výběr a odběr klinických vzorků, jejich transport a zpracování. Pokroky v molekulární typizaci T. p. pallidum v klinickém materiálu přispějí k rozvoji epidemiologie syfilis a přinesou možnosti rozlišení mezi reinfekcí a reaktivací syfilitického procesu.

Anglicky

Prooblems and solutions in PCR diagnostics of syphilis are discussed and analyzed.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV
Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů