MIKOLKA, Pavol a David ŠMAJS. Určovanie genómovej sekvencie Treponema pallidum subspecies pallidum kmeňa Dallas 1. In 51. Studentská vědecká konference. Program a abstrakta. 2007.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Určovanie genómovej sekvencie Treponema pallidum subspecies pallidum kmeňa Dallas 1
Název anglicky Complete genome sequence of Treponema pallidum subspecies pallidum Dallas 1
Autoři MIKOLKA, Pavol (703 Slovensko) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant).
Vydání 51. Studentská vědecká konference. Program a abstrakta. 2007.
Další údaje
Originální jazyk slovenština
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14110/07:00019073
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Klíčová slova anglicky Complete genome sequence; Treponema pallidum subspecies pallidum
Štítky Complete genome sequence, Treponema pallidum subspecies pallidum
Změnil Změnil: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Změněno: 8. 4. 2010 15:20.
Anotace
Treponema pallidum ssp. pallidum Dallas 1 je jedným z kmeňov spôsobujúci syfilis. Tento kmeň bol izolovaný v Dallase a s kmeňom Nichols objaveným v roku 1912 vo Washingtone patria do rovnakého poddruhu. K určeniu variability kmeňov poddruhu T. p. pallidum sme sekvencovali genom kmeňa Dallas 1 pomocou pyrosekvencovania (454 Life Sciences). Táto metóda je zvlášť vhodná pre určenie kompletnej sekvencie genómov mikroorganizmov, ktoré nie sme schopní kultivovať v podmienkach in vitro. Celogenómové rozdiely medzi kmeňmi Dallas 1 a Nichols pozostávali z 85 SNP, 143 jednonukleotidových delecií a inzercií (indelov) a 4 dlhších indelov o dĺžke 2 až 4 bp. Stanovenie sekvenčných rozdielov medzi jednotlivými genomami príbuzných treponem bude použité pre určenie vnútropoddruhovej (vnútry poddruhu T. p. pallidum) a medzipoddruhovej variability (medzi poddruhami T. p. pallidum a T. p. pertenue).
Anotace anglicky
The complete genome sequence of Treponema pallidum subspecies pallidum Dallas 1 was established and analyzed.
Návaznosti
GA310/07/0321, projekt VaVNázev: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaVNázev: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
VytisknoutZobrazeno: 20. 4. 2024 02:44