GC Content in Plant Genomes

D 2007

GC Content in Plant Genomes

BUREŠ, Petr; Petr ŠMARDA; Ivana HRALOVÁ; Sara FUNES-SORIANO; Martin LYSÁK et. al.

Základní údaje

Originální název

GC Content in Plant Genomes

Název česky

GCbsah v rostlinných genomech

Autoři

BUREŠ, Petr; Petr ŠMARDA; Ivana HRALOVÁ; Sara FUNES-SORIANO; Martin LYSÁK; Radomír ŘEPKA; Klára HELÁNOVÁ; Olga ROTREKLOVÁ; Jana PROCHÁZKOVÁ; Luboš ÚRADNÍČEK a Jana KŮROVÁ

Vydání

Brno, Analytical Cytometry IV, od s. 19-20, 2 s. 2007

Nakladatel

Czech Society for Analytical Cytometry

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Kód RIV

RIV/00216224:14310/07:00022323

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-239-9591-6

Klíčová slova anglicky

Genome size; base composition; Carex; Eleocharis; Festuca; Apiaceae; Brassicaceae; Epilobium; Salix

Štítky

Apiaceae, base composition, Brassicaceae, Carex, Eleocharis, Epilobium, Festuca, genome size, Salix

Příznaky

Mezinárodní význam

Změněno: 26. 3. 2019 22:01, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

GC base pair content is an important character in the description of new taxa of prokaryotes, but its role in plant systematics and evolution is still poorly understood. Using flow cytometry methods (FCM) with PI and DAPI, we estimated base composition in Apiaceae (16 spp.), Brassicaceae (30 spp.), Cyperaceae (135 spp.), Onagraceae (15 spp.), Poaceae (132 spp.) and Salicaceae (20 spp.), and found a significant positive correlation between GC content and genome size.

Česky

Obsah GC bazí je znakem používáným obecně zejména v taxonomii prokaryot, avšak jeho role v evoluci rostlin zůstává zatím nejasná. S použitím průtokové cytometrie jsme stanovili zastoupení bazí v genomech Apiaceae (16 spp.), Brassicaceae (30 spp.), Cyperaceae (135 spp.), Onagraceae (15 spp.), Poaceae (132 spp.) a Salicaceae (20 spp.). Nalezli jsme v rámci těchto příbuzenských okruhů signifikantní klorelaci mezi velikostí genomu a zastoupením GC bazí.

Návaznosti

LC06073, projekt VaV

Název: Centrum pro výzkum biodiverzity

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity

MSM0021622416, záměr

Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Citovat

BUREŠ, Petr; Petr ŠMARDA; Ivana HRALOVÁ; Sara FUNES-SORIANO; Martin LYSÁK; Radomír ŘEPKA; Klára HELÁNOVÁ; Olga ROTREKLOVÁ; Jana PROCHÁZKOVÁ; Luboš ÚRADNÍČEK a Jana KŮROVÁ. GC Content in Plant Genomes. In Analytical Cytometry IV. Brno: Czech Society for Analytical Cytometry, 2007, s. 19-20. ISBN 978-80-239-9591-6.

@inproceedings{720761,
   author = {Bureš, Petr and Šmarda, Petr and Hralová, Ivana and FunesandSoriano, Sara and Lysák, Martin and Řepka, Radomír and Helánová, Klára and Rotreklová, Olga and Procházková, Jana and Úradníček, Luboš and Kůrová, Jana},
   address = {Brno},
   booktitle = {Analytical Cytometry IV},
   keywords = {Genome size; base composition; Carex; Eleocharis; Festuca; Apiaceae; Brassicaceae; Epilobium; Salix},
   howpublished = {tištěná verze "print"},
   language = {eng},
   location = {Brno},
   isbn = {978-80-239-9591-6},
   pages = {19-20},
   publisher = {Czech Society for Analytical Cytometry},
   title = {GC Content in Plant Genomes},
   year = {2007}
}

TY  - CONF
ID  - 720761
AU  - Bureš, Petr - Šmarda, Petr - Hralová, Ivana - Funes-Soriano, Sara - Lysák, Martin - Řepka, Radomír - Helánová, Klára - Rotreklová, Olga - Procházková, Jana - Úradníček, Luboš - Kůrová, Jana
PY  - 2007
TI  - GC Content in Plant Genomes
PB  - Czech Society for Analytical Cytometry
CY  - Brno
SN  - 9788023995916
KW  - Genome size
KW  - base composition
KW  - Carex
KW  - Eleocharis
KW  - Festuca
KW  - Apiaceae
KW  - Brassicaceae
KW  - Epilobium
KW  - Salix
N2  - GC base pair content is an important character in the description of new taxa of prokaryotes, but its role in plant systematics and evolution is still poorly understood. Using flow cytometry methods (FCM) with PI and DAPI, we estimated base composition in Apiaceae (16 spp.), Brassicaceae (30 spp.), Cyperaceae (135 spp.), Onagraceae (15 spp.), Poaceae (132 spp.) and Salicaceae (20 spp.), and found a significant positive correlation between GC content and genome size.
ER  -

BUREŠ, Petr; Petr ŠMARDA; Ivana HRALOVÁ; Sara FUNES-SORIANO; Martin LYSÁK; Radomír ŘEPKA; Klára HELÁNOVÁ; Olga ROTREKLOVÁ; Jana PROCHÁZKOVÁ; Luboš ÚRADNÍČEK a Jana KŮROVÁ. GC Content in Plant Genomes. In \textit{Analytical Cytometry IV}. Brno: Czech Society for Analytical Cytometry, 2007, s.~19-20. ISBN~978-80-239-9591-6.

Přehled o publikaci